研究業績 · からだ工務店/architect-Bio

研究項目A01 #

計画研究 #

発表論文＜47件＞ #

Hirooka E, Hattori R, Ikawa K, Kobayashi T, Matsuyama M, Igaki T, Ohsawa S, Macrophages promote tumor growth by phagocytosis-mediated cytokine amplification in Drosophila, Curr. Biol., in press
Enomoto M, Ohsawa S, Cancer progression through systemic signaling viewed from Drosophila, Curr. Opin. Cell Biol., in press
Akai N, Yagi Y, Igaki T, *Ohsawa S, JNK signaling coordinates epithelial cell turnover through exocytosis in Drosophila ribosomal protein mutants, iScience, in press
Wang K, Suyama R, Mizutani N, Matsuo M, Peng Y, Seki M, Suzuki Y, Luscombe NM, Dantec C, Lemaire P, Toyoda A, Nishida H, *Onuma TA.　Transcriptomes of a fast-developing chordate uncover drastic differences in transcription factors and localised maternal RNA composition compared with those of ascidians. Development, 152(6), DEV202666 (2025)
Sugiura K, Terano T, Adachi H, Hagiwara J, Matsuda K, Nishida K, Hanson P, Kondo S, *Gotoh H. A general theory of the complex pronotum morphology of treehoppers in Smiliinae and its relatives (Insecta: Hemiptera: Membracidae) and its applicability to other subfamilies. European Journal of Entomology, 122, 42-55 (2025)
*Gotoh H, Ohtsu I, Umino T, Yamasaki YY, Minakuchi Y, Ito T, Toyoda A, Kitano J. Induction of male-like mandibles in XX individuals of a stag beetle by gene knockdown of a feminizer gene transformer. Journal of Experimental Zoology part B, 344(1), 7-13 (2024)
*Shinohara T, Gotoh H. Variation of the number and size of spines on the adult body in Dactylispa Weise 1897 (Coleoptera: Chrysomelidae: Cassidinae). Zoomorphology, 143(2), 383-393 (2024)
*Matsuda K, Adachi H, Gotoh H, Inoue Y, *Kondo S Adhesion and shrinkage transform the rounded pupal horn into an angular adult horn in Japanese rhinoceros beetle. Development, 151(20), dev202082 (2024)
Sugiura K, Terano T, Adachi H, Hagiwara J, Matsuda K, Nishida K, Hanson P, Kondo S, *Gotoh H. Histological observation of helmet development in the treehopper Poppea capricornis (Insecta: Hemiptera: Membracidae). Zoological Science, 41(2), 167-176 (2024)
*田尻怜子. クチクラタンパク質による昆虫の体形づくり：体形を“表面的に”制御する分子の働き. 蚕糸・昆虫バイオテック, 93(1), 7-12 (2024)
*Kuroda J, Hino H, Kondo S. Dynamics of actinotrichia, fibrous collagen structures in zebrafish fin tissues, unveiled by novel fluorescent probes. PNAS Nexus 3(7), pgae266 (2024)
Hino H, Kondo S, *Kuroda J. In vivo imaging of bone collagen dynamics in zebrafish. Bone Reports. 20, 101748 (2024)
*Plessy C, Mansfield MJ, Bliznina A, Masunaga A, West C, Tan Y, Liu AW, Grašič J, del Río Pisula MS, Sánchez-Serna G, Fabrega-Torrus M, Ferrández-Roldán A, Roncalli V, Navratilova P, Eric M. Thompson EM, Onuma T, Nishida H, *Cañestro C, Luscombe NM. Extreme genome scrambling in marine planktonic Oikopleura dioica cryptic species. Genome Research, 34(3), 426-440 (2024)
*Weber JN, Kojima W, Boisseau RP, Niimi T, Morita S, Shigenobu S, Gotoh H, Araya K, Lin CP, Thomas-Bulle C, Allen CE, Tong W, Lavine LC, Swanson BO, *Emlen DJ. Evolution of horn length and lifting strength in the Japanese rhinoceros beetle Trypoxylus dichotomus. Current Biology, 33(20), 4285-4297 (2023)
Morita S, Shibata TF, Nishiyama T, Kobayashi Y, Yamaguchi K, Toga K, Ohde T, Gotoh H, Kojima T, Weber JN, Salvemini M, Bino T, Mase M, Nakata M, Mori T, Mori S, Cornette R, Sakura K, Lavine LC, Emlen DJ, *Niimi T, *Shigenobu S. The draft genome sequence of the Japanese rhinoceros beetle Trypoxylus dichotomus septentrionalis towards an understanding of horn formation. Scientific Reports 13(1), 8735 (2023)
Hagiwara J, Nozawa L, Ohtsu I, Shinohara T, *Gotoh H. Pupal RNA interference methods for analyzing adult development in stag beetles. Entomological Science, 26(2), e12548 (2023)
Sugiyama M, Ozawa T, Ohta K, Okada K, Niimi T, Yamaguchi K, Shigenobu S, *Okada Y. Transcriptomic and functional screening of weapon formation genes implies significance of cell adhesion molecules and female-biased genes in broad-horned flour beetle. PLOS Genetics, 19(12), e1011069 (2023)
Tajiri R, Hirano A, Kaibara Y, Tezuka D, Chen Z, *Kojima T. Notch signaling generates the “cut here line” on the cuticle of the puparium in Drosophila melanogaster. iScience, 26(8), 107279 (2023).
森田慎一, *新美輝幸. マイクロ CT を用いた昆虫形態研究. 昆虫と自然, 58(13), 5-11 (2023)
*田尻怜子. クチクラの変形による昆虫の形づくり. 昆虫と自然, 58(2), 36-39 (2023)
Nakagawa H, Aramaki T, Kondo S, *Kuroda J. Collagen9a1c localizes to collagen fibers called actinotrichia in zebrafish fins. microPublication Biology (2023)
Konishi M, Kishi K, Morita R, Yamada A, Onuma TA, *Nishida H. Formation of the brain by stem cell divisions of large neuroblasts in Oikopleura dioica, a simple chordate. Development Genes and Evolution, 233(1), 35-47 (2023)
*Treen N, Konishi S, Nishida H, Onuma TA, Sasakura Y. Zic-r.b controls cell numbers in Ciona embryos by activating CDKN1B. Developmental Biology. 498, 26-34 (2023)
Ohtsu I, Chikami Y, Umino T, *Gotoh H. Evaluation of Body Size Indicators for Morphological Analyses in Two Sister Species of Genus Dorcus (Coleoptera, Lucanidae). Journal of Insect Science, 22(5) (2022)
Sakura, K., Morita, S. and *Niimi, T. RNA interference method for gene function analysis in the Japanese rhinoceros beetle Trypoxylus dichotomus. Bio-protocol, 12(08), e4396 (2022)
Morita S, Sakura K, Gotoh H, Emlen DJ, *Niimi T. Recent advances in understanding horn formation in the Japanese rhinoceros beetle Trypoxylus dichotomus using next-generation sequencing technology. Current Opinion in Insect Science, 51, 100901 (2022)
*田尻怜子. うじ虫の皮が体を形づくるしくみ. 生体の科学, 73(4), 348-352 (2022)
*Masunaga A, Mansfield MJ, Tan Y, Liu AW, Bliznina A, Barzaghi P, Hodgetts TL, Ferrández‐Roldán A, Cañestro C, Onuma TA, Plessy C, Luscombe NM. The cosmopolitan appendicularian Oikopleura dioica reveals hidden genetic diversity around the globe. Marine Biology, 169(12), 157 (2022)
*Onuma TA, Nishida H. Developmental biology of the larvacean Oikopleura dioica: Genome resources, functional screening, and imaging. Development Growth and Differentiation, 64(1), 67-82 (2022)
Yamagishi M, Huang T, Hozumi A, Onuma TA, Sasakura Y, *Ogasawara M. Differentiation of endostyle cells by Nkx2-1 and FoxE in the ascidian Ciona intestinalis type A: insights into shared gene regulation in glandular- and thyroid-equivalent elements of the chordate endostyle. Cell and Tissue Research, 390(2), 189-205 (2022)
*Nishida H, Matsuo M, Kounishi S, Ohno N, Manni L, Nishino A, Onuma TA. Germline development during embryogenesis of the larvacean, Oikopleura dioica. Developmental Biology, 481, 188-200 (2022)
Nagata R, Akai N, Kondo S, Saito K, Ohsawa S and Igaki T. Yorkie drives supercompetition by non-autonomous induction of autophagy via bantam microRNA in Drosophila. Current Biology, 32(5), 1064-1076 (2022)
Kondo S. The present and future of Turing models in developmental biology. Development, 149(24), dev200974 (2022)
Nakagawa H, Kuroda J, Aramaki T, *Kondo S. Mechanical role of actinotrichia in shaping the caudal fin of zebrafish. Developmental Biology, 481, 52-63 (2022)
Matsuda K, Gotoh H, Adachi H, Inoue Y, *Kondo S. Computational analyses decipher the primordial folding coding the 3D structure of the beetle horn. Scientific Reports, 11(1) 1-12 (2021)
*Tajiri R, Fujiwara H, *Kojima T. A corset function of exoskeletal ECM promotes body elongation in Drosophila. Communications Biology, 4(1), 88 (2021)
*Onuma TA, Nakanishi R, Sasakura Y, *Ogasawara M. Nkx2-1 and FoxE regionalize glandular (mucus-producing) and thyroid-equivalent traits in the endostyle of the chordate Oikopleura dioica. Developmental Biology, 477, 219-231 (2021)
Martí-Solans J, Godoy-Marín H, Diaz-Gracia M, Onuma TA, Hiroki Nishida H, *Albalat R, *Cañestro C. Massive gene loss and function shuffling in appendicularians stretch the boundaries of chordate Wnt family evolution. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 9, 700827 (2021)
Cong B, Nakamura M, Sando Y, Kondo T, Ohsawa S and *Igaki T. JNK and Yorkie drive tumor malignancy by inducing L-amino acid transporter 1 in Drosophila. PLOS Genetics, 17(11), e1009893 (2021)
#Akai N, #*Ohsawa S (# Equal Contribution), Sando Y. *Igaki T. Epithelial cell-turnover ensures robust coordination of tissue growth in Drosophila ribosomal protein mutants. PLOS Genetics, 17(1), e1009300 (2021)
Wada Y, Ohsawa S, *Igaki T. Yorkie ensures robust tissue growth in Drosophila ribosomal protein mutants. Development, 148(14), dev198705 (2021)
*Adachi H, Ozawa M, Yagi S, Seita M, Kondo S. Pivot burrowing of scarab beetle (Trypoxylus dichotomus) larva. Scientific Reports, 11(1), 14594 (2021)
Ei SI, Ishii H, Kondo S, Miura T, *Tanaka Y. Effective nonlocal kernels on reaction-diffusion networks. Journal of Theoretical Biology, 509, 110496 (2021)
Gotoh H, Adachi H, Matsuda K, *Lavine LC. Epithelial folding determines the final shape of beetle horns. Current Opinion in Genetics & Development, 69, 122-128 (2021)
*Kondo S, Watanabe M, Miyazawa S. Studies of Turing pattern formation in zebrafish skin. Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, 379(2213), 20200274 (2021)
*新美輝幸. 特集:「武器形質研究の最前線」にあたって. 蚕糸昆虫バイオテック, 89(3), 125-131 (2020)
森田慎一, *新美輝幸. カブトムシの角発生メカニズム. 蚕糸昆虫バイオテック, 89(3), 145-151 (2020)

＜学会発表100 件＞ #

池田真一郎, 西田宏記, 三輪真紀子, 小沼健. オタマボヤのハウス原基と展開後のハウスの対応関係とを調べる試み. 口頭発表、九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25).
諏訪伸太郎, 渡部夏菜子, 三輪真紀子, 小沼健. ワカレオタマボヤ表皮領域におけるCesA2 の組織化された遺伝子発現の変化を読みとる試み. 口頭発表、九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25).
石津拓海, 三輪真紀子, 小沼健. ワカレオタマボヤの形態形成の完了にともない起きる形態変化（tail shift）について. ポスター発表、九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25).
谷口陽亮, 佐々木けいと,三輪真紀子, 小沼健. Constriction and relaxation of epidermis: オタマボヤのOEにおける方向性と連続性をそなえた動き. ポスター発表、九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25).
西村穗乃央,三輪真紀子, 小沼健. ワカレオタマボヤ表皮細胞のシングル核RNA-seqのための核単離方法の検討. ポスター発表、九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25).
冨安拓真, 柳田夏希,三輪真紀子, 小沼健. オタマボヤハウスの網目形成におけるFアクチン制御の寄与：ROCK阻害剤による検討. ポスター発表、九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25).
武冨祐己, 柳田夏希,三輪真紀子, 小沼健. ワカレオタマボヤの表皮上のハウス原基におけるセルロース繊維構造の形成過程についてポスター発表、九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25).
渡部夏菜子, 三輪真紀子, 小沼健. ワカレオタマボヤの卵および胚の凍結保存の試み. ポスター発表、九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25).
Yoneda, M., Morita, S., Niimi, T., Ohde, T.: Exploration of the genetic mechanisms underlying the development of male-specific horned and flattened head in Loxoblemmus equestris. The 2nd Non-Traditional Arthropod Model Systems, Tokyo, Waseda University, 2024.
Yoneda, M., Morita, S., Niimi, T., Ohde, T.: Exploring the Origin of Novel Traits in the Insect Head: Insights from Bizarre Head Development in Horn-Headed Crickets. International Congress of Entomology, Kyoto, Kyoto International Conference Center, 2024. (国際学会)
森田慎一・石山修・新美輝幸: 甲虫目の強固な外骨格獲得に寄与する新規転写因子. 第 95 回日本動物学会, 長崎県・長崎大学, 2024.
米田瑞穂・森田慎一・新美輝幸・大出高弘: ネッタイオカメコオロギにおいて雄頭部の局所的形態変化をもたらす遺伝子の探索. 第 95 回日本動物学会, 長崎県・長崎大学, 2024.
山岡蒼司・森田慎一・Kim Jeonghyun・前田英次郎・松本健郎: 骨構造の自発創成を目指した鶏雛脛骨薄切片の曲げ負荷培養. 第35回バイオフロンティア講演会, 神奈川県・横浜国立大学, 2024.
米田瑞穂・森田慎一・新美輝幸・大出高弘: ネッタイオカメコオロギをモデルとした頭部新奇形質の発生メカニズムの探索. 第68回日本応用動物昆虫学会大会, 宮城県, 仙台国際センター, 2024.
Tajiri R. Body shape control by the cuticle in Drosophila. Society for Developmental Biology 83rd Annual Meeting 2024年7月16日 [招待あり]
錯覚ワークショップ2024 年 3 月 4 日（月）、5 日（火）明治大学中野キャンパス　遠近法と錯視の関係　近藤滋
日本分子生物学会＠福岡　2024年 11月 26日～ 29日システムバイオロジー反省会　近藤滋
生物物理若手@札幌　2024年 8月 26日～ 29日　模様形成からカタツムリの角まで　近藤滋
皮膚科学会　沖縄　2024年 6月 22日～ 23日　皮膚模様の形成とコラーゲン　近藤滋
東北大学　turingシンポジウム　2024年 2月 8日～ 10日　反応拡散系の展開　近藤滋
Noriko Funayama. 針状ケイ酸体を細胞が産生、運搬、繋げるカイメン骨片骨格形成機構The Mechanism of Sponge Spiculous Skeleton construction, Active Manipulation of Siliceous Spicules (Needle-Like Structures ) and Collagen Matrix by Specific Cell Types,口頭発表　第47回日本分子生物学会年会 (2024) 　第47回日本分子生物学会年会 (2024)　公募シンポジウム　「非細胞素材」による形態形成のメカニズム」大澤さんと船山でオーガナイズした中での口頭発表。
Ueda T, Kashima M, Funayama N. 細胞集団がガラス質の骨片を運搬するメカニズムの解明に向けてTowards Elucidating the Cellular and Molecular Mechanisms of Siliceous Spicule Transport by Collective Cell Behavior in the Freshwater Sponge, Ephydatia fluviatilis, ポスター発表　第47回日本分子生物学会年会 (2024)
Ueda T, Kashima M, Funayama N. 細胞集団がガラス質の骨片を運搬するメカニズムの解明に向けてTowards Elucidating the Cellular and Molecular Mechanisms of Siliceous Spicule Transport by Collective Cell Behavior in the Freshwater Sponge, Ephydatia fluviatilis, ポスター発表International Symposium on morphogenesis by non-cellular materials (2024)
Okamoto K, Kamimura S, Okawa M, Funayama N. Attempt to signaling of cellular communication during gemmule formation of freshwater sponge, Ephydatia fluviatilis,　ポスター発表第57回日本発生生物学会 (2024)
Nishizawa T, Matsumoto K, Kamimura S, Komano K, Fujimori T, Funayama N. How the worker cells connect spicules to expand the skeleton in Sponges,　ポスター発表第57回日本発生生物学会(2024)
Takedomi Y, Ikeda S, Miwa M, Onuma TA. Understanding the organization process of cellulose fibers in the house rudiment of the larvacean, Oikopleura dioica. Poster presentation, International Symposium on Morphogenesis by Non-Cellular Materials (Kyoto, Kyoto University Clock Tower Centennial Hall, International Exchange Hall, 2024/11/25).
Taniguchi Y, Sasaki K, Takedomi Y, Miwa M, Onuma TA. Constriction and relaxation of epidermis: A directional and repetitive movement of oikoplastic epidermis of the larvacean, Oikopleura dioica. Poster presentation, International Symposium on Morphogenesis by Non-Cellular Materials (Kyoto, Kyoto University Clock Tower Centennial Hall, International Exchange Hall, 2024/11/25).
Onuma TA, Morikawa K, Adachi H, Miwa M, Kamimura S, Komano K, Yamasaki S, Akiyama M, Kondo S, Inoue Y, Funayama N, Nishida H. Three-dimensional reconstruction of the house, an animal cellulose-based structure, by instantaneous gelatinization imaging. Poster presentation, International Symposium on Morphogenesis by Non-Cellular Materials (Kyoto, Kyoto University Clock Tower Centennial Hall, International Exchange Hall, 2024/11/25).
小沼健. 表皮が分泌する動物性繊維によるハウスの3D建築. . 生物の形づくりと行動の数理 -学術変革A：3G+∞ Fusion Meeting- (富山, 富山大学理学部, 2024/1/19-20).
渡部夏菜子, 三輪真紀子, 金子武人, 成瀬清, 小沼健. ワカレオタマボヤの卵および胚の凍結保存の試み. 口頭発表、Cryopreservation Conference 2024 (愛知、岡崎カンファレンスセンター、2024/11/21-22).
小沼健, 三輪真紀子. オタマボヤハウスの立体画像撮影法 (iGi)と3D プリンターによる再構築. 口頭発表、第9回ユニーク会 (神奈川, 北里大学相模原キャンパス, 2024/9/22-23).
小沼健，森川健太郎，足立晴彦，三輪真紀子，上村了美，駒野恭子，山崎慎太郎，秋山正和，近藤滋，井上康博，船山典子，西田宏記. オタマボヤにおけるハウスの立体構造の撮影と3D プリンターによる再構築. 口頭発表、第95回日本動物学会 (長崎, 長崎大学文京キャンパス, 2024/9/12-14).
諏訪伸太郎, 渡部夏菜子, 三輪真紀子, 小沼健. ワカレオタマボヤ表皮細胞におけるセルロース合成酵素 (CesA2) の発現領域を特定する試み. 口頭発表、第95回日本動物学会 (長崎, 長崎大学文京キャンパス, 2024/9/12-14).
Onuma TA, Morikawa K, Adachi H, Miwa M, Kamimura S, Komano K, Yamasaki S, Akiyama M, Kondo S, Inoue Y, Funayama N, Nishida H. Three-dimentional reconstruction of the house, an animal cellulose-based structure, by instantaneous gelatinization imaging (iGi). 口頭発表、第57回日本発生生物学会 (京都, みやこめっせ, 2024/6/19-22).
Niimi, T. and Morita, S.: Towards the understanding of horn development using Trypoxylus dichotomus as a model. Non-Traditional Arthropod Model Systems: Studying Form and Function, Online, 2023. (招待講演、国際学会)
Niimi, T. and Morita, S.: Exploring the Genetic Basis of Horn development of the Japanese Rhinoceros Beetle, Trypoxylus dichotomus. EMBO The Company of Biologists Workshop, Okazaki, Japan, 2023. (招待講演、国際学会)
Niimi, T.: Towards understanding horn formation in the Japanese rhinoceros beetle, Trypoxylus dichotomus. Society of Developmental Biologists Singapore SEMINAR SERIES, Online, 2023. (招待講演)
新美輝幸：昆虫における新奇形質獲得と多様性創出の分子メカニズム. 染色体学会第74回年会　公開講演会「昆虫の科学研究と染色体」，オンライン，2023．(招待講演)
Oda, H., Nakamura, T., Morita, S., Niimi, T. A Study of Asymmetrical Head Morphology in Doubledaya bucculenta. EMBO Workshop ‘Trans-Scale Biology using exotic non-model organisms’, Aichi, NIBB, 2023. (国際学会)
徳島大学先端酵素学研究所シンポジウム　2023年 9月 14日～ 15日　脊椎動物のコラーゲン形成　近藤滋
【特別講演】日本皮膚科学会西部支部学会＠沖縄　2023年 9月 16日～ 17日　形態形成研究における数理モデルの利用　近藤滋
パターンと形の国際シンポ＠明治大　学駿河台キャンパス　2023年 8月 1日～ 3日　形態形成：２次元から３次元へ　近藤滋
Noriko Funayama 細胞が微細な骨片を運搬、建て・繋げて構築するカイメン骨片骨格形成機構 Morphogenesis in which cells act as construction workers to manipulate rigid needle-like materials: Spiculous skeleton construction of sponges, 口頭発表　第46回日本分子生物学会年会(2023)
Ueda T, Arima K, Kamimura S,　Funayama N. Mechanisms of spiculous skeleton construction of demosponges: Attempt to clarify the process from spicule productin to spicule transport, ポスター発表　International Workshop Evolution of resilience, regeneration, and animal complexity - insights from basal metazoans (2023)
Matsumoto K, Nishizawa T, Kamimura S, Funayama N. what cells and mechanisms connect spicules to build up spiculous skeleton in sponges, ポスター発表International Workshop Evolution of resilience, regeneration, and animal complexity - insights from basal metazoans (2023)
Noriko Funayama Conceptually new mechanisms of morphogenesis: cells act as constructors that manipulate rigid materials, 口頭発表International Workshop Evolution of resilience, regeneration, and animal complexity - insights from basal metazoans (2023)
Kaede Okamoto, Kurato Mohri, Satomi Kamimura, Funayama N. カワカイメン芽球コート形成機構：コラーゲンを主成分とする3層構造の中間層に芽球骨片を放射状に配置する細胞・分子機構の解明に向けて, 口頭発表　第94回　日本動物学会大会(2023)
船山典子, 企画シンポジウム　群体性動物の進化と方向性　S11-6 カイメン動物の個体形成と形作り機構,　口頭発表　invited 第94回　日本動物学会大会 (2023)
Noriko Funayama Morphogenesis in which cells act as construction workers to manipulate materials: Spiculous skeleton construction of sponges, 口頭発表　invited EMBO | COB Workshop “Trans-Scale Biology using exotic non-model organisms (2023)
Shutaro Endo, Satomi Kamimura, Funayama N. Identification and attempt to clarify the cellular localization of two α-catenins in demosponge Ephydatia fluviatilis　カワカイメンの２つのα-カテニンの同定と抗体作成による細胞内局在解析の試み, ポスター発表　第56回　日本発生生物学会(2023)
Tomoyuki UEDA, Satomi KAMIMURA, Funayama N. Morphogenesis in which cells act as construction workers: Attempt to clarify the process from spicule production to spicule transport.カイメン骨片骨格形成機構：骨片形成細胞（Sclerocyte）がエクソサイトーシスする骨片にTransport cellsが結合するまでの過程解析の試み, ポスター発表　第56回　日本発生生物学会(2023)
小沼健, 柳田夏希, 山崎慎太郎, 秋山正和, 上村了美, 駒野恭子, 船山典子, 西田宏記. オタマボヤハウスの形成: 繊維素材をもちいた形づくり. House construction with cellulose fibers in the larvacean, Oikopleura dioica. 日本動物学会第94回大会, 第41回ホヤ談話会 (山形, 山形大学小白川キャンパス, 2023/9/7-9).
小沼健.　オタマボヤのハウス展開機構と網目形成. 2023 年度(第33 回)日本数理生物学会大会 S3:企画シンポジウム「⽣物の形態形成と細胞運動に関する実験・数理的な取り組み」 (奈良, 奈良女子大学小白川キャンパス, 2023/9/4-6).
小沼健, 柳田夏希, 山崎慎太郎, 秋山正和, 上村了美, 駒野恭子, 船山典子, 西田宏記.　オタマボヤのハウス形成: 繊維素材をもちいた機能的な網目構造の設計. 日本機械学会第35回バイオエンジニアリング講演会 (仙台, 日立システムズホール, 2023/6/4-5).招待
柳田夏希, 池田真一郎, 三輪真紀子, 小沼健. オタマボヤハウスの網目形成：アクチン重合阻害剤を用いた検討. ポスター発表、第47回日本比較内分泌学会大会およびシンポジウム九州大会 (福岡, 九州大学西新プラザ, 2023/11/17-19).
小西美彩子, 岸香苗, 森田遼, 山田温子, 小沼健, 西田宏記. オタマボヤの脳形成では不等幹細胞分裂が起こっている. 口頭発表、第6回ホヤ研究会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2023/11/3-4).
諏訪伸太郎, 池田真一郎, 渡部夏菜子, 三輪真紀子, 小沼健. オタマボヤのハウス形成についての研究. 口頭発表、第6回ホヤ研究会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2023/11/3-4).
小沼健, 水谷奈那子, 松尾正樹, 彭宇, 西田宏記. . オタマボヤとホヤの胚発生のしくみは異なるのか？：「転写因子の胚生発現」と「母性mRNA の局在」からその実体に迫る. 口頭発表、第6回ホヤ研究会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2023/11/3-4).
諏訪伸太郎, 渡部夏菜子, 三輪真紀子, 小沼健. ワカレオタマボヤ表皮細胞におけるCesA2遺伝子を発現する領域を特定する試み. 口頭発表、日本動物学会第94回大会　(山形, 山形大学小白川キャンパス, 2023/9/7-9).
小沼健, 高見龍輝, 池田真一郎, 三輪真紀子. . オナガオタマボヤにおける表皮細胞の並び方について. ポスター発表、第8回ユニーク会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2023/9/16-17).
諏訪伸太郎, 渡部夏菜子, 三輪真紀子, 小沼健. ワカレオタマボヤ表皮細胞におけるCesA2遺伝子を発現する領域を特定する試み. 口頭発表、第8回ユニーク会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2023/9/16-17).
池田真一郎, 三輪真紀子, 小沼健. 折りたたみの各部位とハウス展開後の部位. 口頭発表、第8回ユニーク会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2023/9/16-17).
南條完知, 水野雅玖, 加藤太一郎, 小沼健, 大場裕一. 海に光をもたらしたプランクトン〜オタマボヤによる “光る素セレンテラジン”の生合成〜. 口頭発表、第8回ユニーク会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2023/9/16-17).
毛利千晶, 三輪真紀子, 小沼健. オタマボヤハウスの「展開の開始」に尻尾の運動は必要か？ポスター発表、第8回ユニーク会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2023/9/16-17).
Niimi, T. and Morita, S.: Towards the elucidation of the molecular mechanism of horn development in Trypoxylus dichotomus. JAPAN-SINGAPORE JOINT DEVELOPMENTAL BIOLOGY MEETING, ““MULTI-SCALE PATTERNING IN DEVELOPMENT” , Online, 2022. (招待講演、国際学会)
森田慎一・新美輝幸: カブトムシの角の機械的強度の増加に関与する転写制御メカニズム. 第 93 回日本動物学会, 東京都・早稲田大学, 2022.
田尻怜子　クチクラによる昆虫の形づくり　定量生物学の会第十回年会 2022年12月16日 [招待あり]
田尻怜子　ショウジョウバエ幼虫の細胞外基質が体型を制御する機構　第95回日本生化学会大会 2022年11月11日 [招待あり]
Tajiri R. ECM coating the Drosophila larval body acts as a “corset” that promotes body elongation. 第74回日本細胞生物学会大会 2022年6月28日 [招待あり]
船山典子作業員細胞が針状構造物を産生、運搬、建て、つなげて建設する新規コンセプトの動物の形作り機構, 口頭発表 invited 2022年度メタロバイオサイエンス研究会（MBS2022）(2022)
Tetsurou Nishizawa, Tomoki Mukai, Sota Takagi, Funayama N. Attempt to establish a gene introduction system in demosponge, Ephydatia fluviatilis. カイメン動物におけるゲノムへの遺伝子導入の試み, ポスター発表　第55回日本発生生物学会(2022)
Rinka Iseki, Junichiro Nakazawa, Masumi Okawa, Tomoyuki Ueda, Shutaro Endo, Takefumi Kondo, Funayama N. Toward understanding the cellular and molecular mechanisms of directional carriage of gemmular spicule during gemmule formation. 芽球形成における、方向性を持った芽球骨片の運搬時に働く細胞・分子機構の解明ポスター発表　第55回日本発生生物学会(2022)
Keiji Matsumoto, Sota Takagi, Satomi Kamimura, Junpei Kuroda, Funayama N.
Analyses of cellular and molecular mechanisms connecting spicules to construct skeleton of demosponges.カイメン骨格を形成している骨片をつなぐ細胞分子機構の解析, ポスター発表　第55回日本発生生物学会(2022)　船山典子
Noriko Funayama, Free Style Workshops WS01-02: What we can learn from sponges; The intelligence through cellular behaviorカイメン骨片骨格形成に学ぶ　細胞挙動による”知”, 口頭発表 Invited 第55回日本発生生物学会(2022) 　
Yusuke Shimooka, Masakazu Akiyama, Funayama N. Yasuhiro Inoue. Three-dimensional simulation on skeletal frame formation of the sponge body, World Congress of Biomechanics 2022 Taipei　Cell Biomechanics 1: Methodology and Modeling track(2022)
Wang K, Suyama R, Mizutani N, Matsuo M, Peng Y, Seki M, Suzuki Y, Luscombe NM, Dantec C, Lemaire P, Toyoda A, Nishida H, Onuma TA. Transcriptomes of the fast-evolving chordate, Oikopleura dioica, uncover drastic difference in transcription factor and post-plasmic RNA composition that is expressed in early embryos from those of ascidians. The 11th International Tunicate Meeting, oral presentation (Kobe, Konan University, 2022/07/10-15).
小沼健, 西田宏記. 脊索動物ワカレオタマボヤを活用した発生生物学. 日本動物学会第93回大会, 大会シンポジウム「海産無脊椎動物―生命情報の宝の山VII―オープンデータサイエンス」(東京, 早稲田大学　早稲田キャンパス, 2022/9/8-10)
小沼健. オタマボヤとホヤの胚発生のしくみは異なるのか？：「転写因子の胚生発現」と「母性mRNAの局在」からその実体に迫る. 第7回ユニーク会. ポスター発表 (名古屋, 名古屋大学野依記念学術交流館, 2022/9/20-21).
Niimi, T. and Morita, S.: Towards the elucidation of the horn formation mechanism in the Japanese rhinoceros beetle. The 93rd Annual Meeting of the Genetics Society of Japan, Joint International Symposium (S1) “Evolution and Development of Insects in New Genomic Era”, Online, 2021. (招待講演)
新美輝幸：テントウムシの斑紋とカブトムシの角について. 第７回コオロギ・オンライン研究会，オンライン開催，2021．(招待講演)
田尻怜子　ECMの変形による形づくり：ショウジョウバエ外骨格を例として　第44回日本分子生物学会年会富澤基金メモリアルワークショップ 2021年12月2日 [招待あり]
船山典子, 細胞が針状ケイ酸体を運び繋ぎ足す新たな動物の骨格建築工法, 第73回日本生物工学会大会(2021)
船山典子, 企画シンポジウム『非細胞素材の加工による「からだ」の形づくりの数理』2021年度第31回日本数理生物学会年会(JSMB2021 Annual Meeting, Conference Schedule)S5企画シンポジウム５(2021)
小沼健.　オタマボヤをもちいて、体づくりのしくみを学ぶ. 日本動物学会日本生態学会九州沖縄植物学会合同鹿児島例会 (鹿児島, 鹿児島大学理学部2号館, 2021/12/11)
小沼健.　1世紀前の謎を解く-「最も単純な体の脊索動物」脊索動物オタマボヤをもちいて左右形成の新しい領域を開拓する. 2021年度動物学会中部支部大会富山大会 (オンライン開催) (2021/12/4-5)
小沼健, 山崎慎太郎, 秋山正和, 西田宏記. オタマボヤのハウス形成:セルロース繊維をもちいた形づくり. House construction with cellulose fibers in the larvacean, Oikopleura dioica. 日本動物学会第92回大会, 第39回ホヤ談話会 (オンライン開催)(米子, 米子コンベンションセンター, 2021/9/2-4).
小沼健. オタマボヤのハウス建築: 動物性セルロースを用いた形づくり. 第6回ユニーク会. 口頭発表 (ハイブリッド開催)( Zoom/ふれあい貸し会議室新宿 No18/名古屋大学, 2021/9/9-10).
小沼健, 中西梨奈, 笹倉靖徳, 小笠原道生. オタマボヤ内柱における分泌関連および甲状腺関連形質の領域化. Regionalization of glandular and thyroid-equivalent traits in the endostyle of Oikopleura dioica. 日本動物学会第92回大会, ポスター発表 P-10 (オンライン開催)(米子, 米子コンベンションセンター, 2021/9/2-4).
山岸雅幸, 小沼健, 笹倉靖徳, 小笠原道生. カタユウレイボヤ幼若体における内柱の領域化と細胞分化. Regionalization and differentiation of endostyle cells in the juvenile of Ciona intestinalis. 日本動物学会第92回大会, ポスター発表 P-11 (オンライン開催)(米子, 米子コンベンションセンター, 2021/9/2-4).
板山紘典, 山岸雅幸, 小沼健, 笹倉靖徳, 小笠原道生.　原索動物の内柱における vWF 様遺伝子群の収斂的発現. Convergent expression of vWF-like genes in the protochodate endostyle. 日本動物学会第92回大会, ポスター発表 P-12 (オンライン開催)(米子, 米子コンベンションセンター, 2021/9/2-4).
Kai Wang, 須山律子, 水谷菜那子, 松尾正樹, Yu Peng, 関真秀, 鈴木　穣, Nicholas M. Luscombe, Christelle Dantec, Patrick Lemaire, 豊田敦, 西田宏記, 小沼健. Transcriptomic analyses of the fast-developing chordate, Oikopleura dioica, uncover re-organization of transcription factors functioning in early embryos and the animal-vegetal axis specification. 第54回日本発生生物学会, ポスター発表 (オンライン発表, 2021/6/17-18)
Niimi, T. and Morita, S.：Towards the elucidation of the horn formation mechanism in the Japanese rhinoceros beetle using NGS analyses. The 43rd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan “Adaptive evolution and genome-wide analysis of fish and insects”, Online, 2020．(招待講演)
新美輝幸：Evo-Devoで探る昆虫の多様性：テントウムシの斑紋とカブトムシの角. 佐々木卓治先生文化功労者顕彰記念オンライン講演会，オンライン開催，2020 ．(招待講演)
森田慎一・加藤輝・前野哲輝・新美輝幸: マイクロフォーカスX線CT法によるカブトムシの角形態の観察と計測. 第14回 NIBB Bioimaging Forum 「非光学的モダリティによる生物イメージングの新展開」. オンライン開催, 2020 ．(招待講演)
Niimi, T. and Morita, S.: Towards the elucidation of the horn formation mechanism in the Japanese rhinoceros beetle using NGS analyses. The 43rd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan, Workshop 1AW-14, “Adaptive evolution and genome-wide analysis of fish and insects”, Online, 2020. (招待講演)
田尻怜子, 藤原晴彦, 小嶋徹也　クチクラの異方的伸長がつくりだす昆虫の体型　第43回日本分子生物学会年会 2020年12月4日
Noriko Funayama. Morphogenesis in which cells act as builders to manipulate rigid materials：skeleton construction of sponges, シンポジウム　オーガナイザー　第43回日本分子生物学会年会(2020)
Onuma TA, Akiyama M, Yamasaki S, Kondo S, and Nishida H.　 House construction with animal fibers in the larvacean, Oikopleura dioica 動物繊維をもちいたオタマボヤの「ハウス」建築第43回日本分子生物学会年会ワークショップ「細胞の物理的性質によって変わる、体の建築様式」 (神戸, ポートアイランド, 2020/12/2-4)
小沼健. 脊索動物オタマボヤをもちいた左右形成のしくみ: 110年前の謎に挑む. 第5回大阪大学豊中地区研究交流会ポスター発表 (オンライン発表, 大阪大学, 2020/12/17).

＜書籍3件＞ #

Morita, S., Sakura, K. and *Niimi, T. (2022) Spectrum of Sex in a Horn of the Japanese Rhinoceros Beetle. In Spectrum of Sex: The Molecular Bases that Induce Various Sexual Phenotypes. (Tanaka, M. and Tachibana, M., eds.), pp. 3-12. Springer Nature Singapore Pte Ltd., Singapore.
いきもののカタチ続・波紋と螺旋とフィボナッチ-多彩なデザインを創り出すシンプルな法則学研　近藤滋2021/9/30
数理科学カイメンの形作りとその数理的アプローチに関して秋山正和　船山典子　2021 9月号

＜主催シンポジウム14件＞ #

International Symposium on Morphogenesis by Non-Cellular Materials 2024年11月25日領域主催
Funayama N. Junpei Kuroda　企画シンポジウム： New researches with unique angles　独自の切り口から新規研究分野を開拓している研究　黒田純平博士とオーガナイズ 57th annual meeting of JSDB (2024)
第47回日本分子生物学会年会　シンポジウム「『非細胞素材』による形態形成のメカニズム」2024/11/27　オーガナイザー：大澤志津江, 船山典子
EMBO Workshop, ‘Trans-Scale Biology’ using exotic non-model organisms 2023/7/25-27　新美
EMBO Workshop, Satellite Meeting, “New Approaches for the Properties of Bio-materials” 2023/7/28　新美
第46回日本分子生物学会年会　シンポジウム「『非細胞素材』による形態形成のメカニズム」2023/12/6　オーガナイザー：田尻怜子, 小沼健
九州沖縄植物学会・日本動物学会九州支部回・日本生態学会九州地区会　三学会合同鹿児島大会 (鹿児島、鹿児島大学理学部2号館、2025/5/24-25) 小沼健
　第6回ホヤ研究会、世話人・主催者 (鹿児島大学理学部 2号館、2023/11/3-4)、参加者39名（うち発表者34名）小沼健
　第8回ユニーク会、世話人代表 (鹿児島大学理学部 2号館、2023/9/16-17)、参加者85名　小沼健
日本動物学会関連集会第41回ホヤ談話会世話人 (山形, 山形大学小白川キャンパス, 2023/9/7-9) 小沼健
第75回日本細胞生物学会シンポジウム“New directions in the role of cell adhesion in multicellular systems”をオーガナイズ 2023年6月28日　大澤
第43回日本分子生物学会年会ワークショップ “Bridging the gap between upstream and downstream mechanisms on morphological diversification in insects” (2020年12月4日) をオーガナイズ田尻
第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム　23年3月　後藤寛貴（代表オーガナイザー）
日本動物学会関連集会 40回ホヤ談話会世話人 (東京, 早稲田大学　早稲田キャンパス, 2022/9/8-10) 小沼健
第22回静岡ライフサイエンスシンポジウム　22年3月　後藤寛貴（代表オーガナイザー）
日本動物学会第92会大会関連集会第39回ホヤ談話会世話人 (オンライン開催)(米子, 米子コンベンションセンター, 2021/9/2-4) 小沼健
第43回日本分子生物学会年会ワークショップ　The architectural style of the body depending on the physical properties of the materials (2020年12月3日)　オーガナイズ船山典子黒田純平

公募研究 #

＜発表論文83件＞ #

*Tsujikawa K, Muramatsu R, *Miyata T. CSF pressure in fetal mice in utero: External factors pressurize the intraventricular space. Developmental Dynamics (2025) (in press)
山城佐和子, 渡邊直樹. 分子可視化で捉えた動く構造間をバネ分子が行き来しながら繋ぐ新しい力伝達. 生物物理, 65(2), 70-73 (2025)
進藤麻子. ツメガエルで探る形態形成と栄養が関わる器官形成. 細胞, 57(5), 9-12 (2025)
Shima C, Ohashi A, Furukawa S, Yamamoto S, Kashimoto R, and *Satoh A. Collagen fiber and cellular dynamics of axolotl skin with aging. Development, Growth & Differentiation, 67(4), 195-204 (2025)
Yamashiro S, Shekhar S, Novak SM, Biswas S, Gregorio CC, *Fowler VM. Actin Filament Pointed Ends: Assays for Regulation of Assembly and Disassembly by Tropomodulin and Tropomyosin. Cytoskeleton (2025)
Yoshimi Y, Yu L, Cresswell R, Guo X, Echevarria-Poza A, Lyczakowski JJ, Dupree R, Kotake T, *Dupree P. Glucomannan engineering highlights the role of galactosyl modification in fine-tuning cellulose-glucomannan interaction in Arabidopsis cell walls. Nature Communications, 16(1), 1235 (2025)
Ohashi A, Sakamoto H, Kuroda J, Kondo Y, Kamei Y, Nonaka S, Furukawa S, Yamamoto S, *Satoh A. Keratinocyte-driven dermal collagen formation in the axolotl skin. Nature Communications, 16(1), 1757 (2025)
*Readhead C, *Mahler S, Dong Z, Sato Y, Yang C, Bronner ME. Automated non-invasive laser speckle imaging of the chick heart rate and extraembryonic blood vessels and their response to Nifedipin and Amlodipine drugs. Developmental Biology, 519, 46-54 (2025)
*Ichimura T, Kakizuka T, Taniguchi Y, Ejima S, Sato Y, Itano K, Seiriki K, Hashimoto H, Sugawara K, Itoga H, Onami S, *Nagai T. Volmetric trans-scale imaging of massive quantity of heterogenous cell populations in centimeter-wide tissue and embryo. eLife, 13, RP93633 (2025)
Abe K, Hashimura H, Hiraoka H, Fujishiro S, Kameya N, Taoka K, Kuwana S, Fukuzawa M, *Sawai S. Cell–cell heterogeneity in phosphoenolpyruvate carboxylase biases early cell fate priming in Dictyostelium discoideum. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 12, 1526795 (2025)
Asai H, Ono M, Miyata T, *Hattori Y. FlashTag-mediated Labeling for Intraventricular Macrophages in the Embryonic Brain, Bio-protocol, 15(2), e5166 (2025)
Hiraiwa S, *Kojima T. Long-Term Live Imaging of Drosophila Pupal Leg Development After Puparium Removal. Journal of Visualized Experiments, 215, e67597 (2025)
Brimson CA, Baines R, Sams-Dodd E, Stefanescu I, Evans B, Kuwana S, Hashimura H, Sawai S, *Thompson CR. Collective oscillatory signaling in Dictyostelium discoideum acts as a developmental timer initiated by weak coupling of a noisy pulsatile signal. Developmental Cell, 60(6), 918-933.e4 (2025)
*Kotake T, Takahashi D. On the separate metabolisms of UDP-sugars and GDP-sugars in plants. Trends in Glycoscience and Glycotechnology, 36(209), E6-E11 (2024)
Umezawa A, Matsumoto M, Handa H, Nakazawa K, Miyagawa M, Seifert GJ, Takahashi D, *Fushinobu S, *Kotake T. Cytosolic UDP-L-arabinose synthesis by bifunctional UDP-glucose 4-epimerases in Arabidopsis. The Plant Journal, 119, 508-524 (2024)
Chowhan S, Kikuchi T, Ohashi M, Kutsuno T, Handa H, Kotake T, *Takahashi D. Soluble sugars make a greater contribution than cell wall components to the variability of freezing tolerance in wheat cultivars. Plant Biotechnology, 41(4), 401-415 (2024)
*Ichimura T, Kakizuka T, Sato Y, Fujioka Y, Ohba Y, Horikawa K, Nagai T. Strength in numbers: Unleashing the potential of trans-scale-scope AMATERAS for massive cell quantification, Biophysics and Physicobiology, 21, e211017 (2024)
Hashimura H, Kuwana S, Nakagawa H, Abe K, Adachi T, Sugita T, Fujishiro S, Honda G, *Sawai S. Multi-color fluorescence live-cell imaging in Dictyostelium discoideum. Cell Structure and Function, 49(2), 135-153 (2024) (表紙に選定)
*Shimamura T, *Miyata T. Quantitative in toto live imaging analysis of apical nuclear migration in the mouse telencephalic neuroepithelium. Development, Growth & Differentiation, 66(9), 462-474 (2024)
Murayama F, Asai H, Patra A. K, Wake H, Miyata T, *Hattori Y. A novel preparation for histological analyses of intraventricular macrophages in the embryonic brain. Development, Growth & Differentiation, 66(5), 329-337 (2024)
*Inaki M, Higashi T, Okuda S, *Matsuno K. Distinct cellular and junctional dynamics independently regulate the rotation and elongation of the internal organ. PLOS Genetics, 20(10), e1011422 (2024)
*Strauß J, Stritih-Peljhan N, Nishino H. Vibration receptor organs in the insect leg: neuroanatomical diversity and functional principles. Current Opinion in Insect Science, 61, 101153-101153 (2024)
Tateishi K, Watanabe T, Domae M, Ugajin A, Nishino H, Nakagawa H, Mizunami M, *Watanabe H. Interactive parallel sex pheromone circuits that promote and suppress courtship behaviors in the cockroach. PNAS Nexus, 3(4), pgae16 (2024)
*Tanaka Y, Okayama S, Urakawa K, Kudoh H, Ansai S, Abe G, *Tamura K. Anterior-posterior constraint on Hedgehog signaling by hhip in teleost fin elaboration. Development, 151(22), dev202526 (2024)
*Wakamatsu Y, Takeda Y, Tamura K, Suzuki K, Kiyonari H, Yamada G. Comparative Analyses Reveal Conserved and Modified Steps in the Testis Descent and Scrotum Development in Mouse and Opossum. Cells Tissues Organs, 1-12 (2024)
Kawasumi-Kita A, Ohtsuka D, Lee S, Kitajima K, Sakane Y, Tamura K, Ochi H, Suzuki K, *Morishita Y. hoxc12/c13 as key regulators for rebooting the developmental program in Xenopus limb regeneration. Nature Communications, 15, 3340 (2024)
Kudoh H, Yonei-Tamura S, Abe G, Iwakiri J, Uesaka M, Makino T, *Tamura K. Genomic screening of fish-specific genes and their functions in fin development. Development, Growth & Differentiation, 66(3), 235-247 (2024)
*Miyamoto K, Abe G, *Tamura K. The dwarf neon rainbowfish Melanotaenia praecox, a small spiny-rayed fish with potential as a new Acanthomorpha model fish: I. Fin-ray ontogeny and postembryonic staging. Developmental Dynamics, 253(9), 829-845 (2024)
*Miyamoto K, Abe G, Kawakami K, *Tamura K, Ansai S. The dwarf neon rainbowfish Melanotaenia praecox, a small spiny-rayed fish with potential as a new Acanthomorpha model fish: II. Establishment of a microinjection procedure for genetic engineering. Developmental Dynamics, 253(9), 815-828 (2024)
Hiraiwa S, Takeshita S, Terano T, Hayashi R, Suzuki K, Tajiri R, *Kojima T. Unveiling the cell dynamics during the final shape formation of the tarsus in Drosophila adult leg by live imaging. Development Genes and Evolution, 234(2), 117-133 (2024)
*Mujizah EY, Kuwana S, Matsumoto K, Gushiken T, Aoyama N, Ishikawa HO, Sasamura T, Umetsu D, *Inaki M, *Yamakawa T, *Baron M, and *Matsuno K. Numb Suppresses Notch-Dependent Activation of Enhancer of split during Lateral Inhibition in the Drosophila Embryonic Nervous System. Biomolecules, 14(9), 1062 (2024)
*Nagano Y, *Inaki M, Matsuno K. High-precision calorimetry-based analysis of pupal-pharate adult development in Drosophila melanogaster. Zoological Science, 41(4), 400-406 (2024)
Utsunomiya S, Takebayashi K, Yamaguchi A, Sasamura T, Inaki M, Ueda M, *Matsuno K. Left-right Myosin-Is, Myosin1C, and Myosin1D exhibit distinct single molecule behaviors on the plasma membrane of Drosophila macrophages. Genes to Cells, 29(5), 380-396 (2024)
進藤麻子. 体の形を決める遺伝子・細胞・環境の相互作用. ドージンニュース, 191, 9-12 (2024)
進藤麻子. アクトミオシンによる形態恒常性の維持機構. 医学のあゆみ, 290(1), 17-21 (2024)
進藤麻子. アフリカツメガエル胚で解く形の謎. 生産と技術, 76(3), 44-46 (2024)
熊野岳. クラゲ触手枝分かれから見える動物の形づくり. 細胞, 56(5), 388-391 (2024)
*Ghosh K, Takahashi D, *Kotake T. Plant type II arabinogalactan: Structural features and modification to increase functionality. Carbohydrate Research, 529, 108828 (2023)
Ohashi A, Terai S, Furukawa S, Yamamoto S, Kashimoto R, *Satoh A. Tenascin-C-enriched regeneration-specific extracellular matrix guarantees superior muscle regeneration in Ambystoma mexicanum. Developmental Biology, 504, 98-112 (2023)
*Sato Y, Shigematsu M, Shibata-Kanno M, Maejima S, Tamura C, Sakamoto H. Aquaporin regulates cell rounding through vacuole formation during endothelial-to-hematopoietic transition. Development, 150(11), dev201275 (2023)
*Hattori Y, Kato D, Murayama F, Koike S, Asai H, Yamasaki A, Naito Y, Kawaguchi A, Konishi H, Prinz M, Masuda T, Wake H, Miyata T. CD206+ macrophages transventricularly infiltrate the early embryonic cerebral wall to differentiate into microglia. Cell Reports, 42(2), 112092 (2023)
Katsuta H, Okuda S, Nagayama K, Machiyama H, Kidoaki S, Kato M, Sokabe, Miyata T, *Hirata H. Actin crosslinking bya-actinin averts viscous dissipation of myosin force transmission in stress fibers. iScience, 26(3), 106090 (2023)
Lai Y, Sasamura T, Kuroda J, Maeda R, Nakamura M, Hatori R, Ishibashi T, Taniguchi K, Ooike M, Taguchi T, Nakazawa N, Hozumi S, Okumura T, Aigaki T, *Inaki M, *Matsuno K. The Drosophila AWP1 ortholog Doctor No regulates JAK/STAT signaling for left-right asymmetry in the gut by promoting receptor endocytosis. Development, 150(6), dev201224 (2023)
Fujita S, Takahashi M, Kumano G, Kuranaga E, Miura M, *Nakajima Y. Distinct stem-like cell populations facilitate functional regeneration of the Cladonema medusa tentacle. PLOS Biology, 21(12), e3002435 (2023)
*Watanabe H, Ogata S, Nodomi N, Tateishi K, Nishino H, Matsubara R, Ozaki M, Yokohari F. Cuticular hydrocarbon reception by sensory neurons in basiconic sensilla of the Japanese carpenter ant. Frontiers in Cellular Neuroscience, 17, 1084803 (2023)
*Morishita Y, Lee SW, Suzuki T, Yokoyama H, Kamei Y, Tamura K, Kawasumi-Kita A. An archetype and scaling of developmental tissue dynamics across species. Nature Communications, 14, 8199 (2023)
Tada R, Higashidate T, Amano T, Ishikawa S, Yokoyama C, Kobari S, Nara S, Ishida K, Kawaguchi A, Ochi H, Ogino H, Yakushiji-Kaminatsui N, Sakamoto J, Kamei Y, Tamura K, *Yokoyama H. The shh limb enhancer is activated in patterned limb regeneration but not in hypomorphic limb regeneration in Xenopus laevis. Developmental Biology, 500, 22-33 (2023)
*Tsuboi A, Fujimoto K, *Kondo T. Spatiotemporal remodeling of extracellular matrix orients epithelial sheet folding, Science Advances, 9(35), eadh2154 (2023)
*Yamashiro S, Rutkowski DM, Lynch KA, Liu Y, Vavylonis D, Watanabe N. Force transmission by retrograde actin flow-induced dynamic molecular stretching of Talin. Nature Communications, 14, 8468 (2023)
Mizoguchi Y, Nakashima K, Sato A, and *Shindo A. β-adrenergic receptor regulates embryonic epithelial extensibility through actomyosin inhibition. iScience, 26(12), 108469 (2023)
*Shindo A. Tissues flow and grow. Nature Physics, 19(7), 938 (2023)
Masuda W, Yamakawa T, Ajima R, Miyake K, Umemiya T, Azuma K, Tamaru J, Kiso M, Das P, Saga Y, Matsuno K, *Kitagawa M. TM2D3, a mammalian homologue of Drosophila neurogenic gene product Almondex, regulates surface presentation of Notch receptors. Scientific Reports, 13, 20913 (2023)
Sakamura S, Hsu F, Tsujita A, Abubaker MB, Chiang A, *Matsuno K. Ecdysone signaling determines lateral polarity and remodels neurites to form Drosophila’s left-right brain asymmetry. Cell Reports, 42(4), 112337 (2023)
*Matsuo I, Kimura-Yoshida C, Ueda Y. Developmental and mechanical roles of Reichert’s membrane in mouse embryos. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 377(1865), 20210257 (2022)
Tsume-Kajioka M, Kimura-Yoshida C, Mochida K, Ueda Y, *Matsuo I. BET proteins are essential for the specification and maintenance of the epiblast lineage in mouse preimplantation embryos. BMC Biology, 20, 64 (2022)
*Matsuo I, Kimura-Yoshida C. Identification of Cell Autonomous and Non-Cell Autonomous Functions of Heparan Sulfate Glycosaminoglycan Chains by Creating Chimeric Mouse Embryos. Methods in Molecular Biology, 2303, 579-593 (2022)
*Kimura-Yoshida C, Mochida K, Kanno S, *Matsuo I. USP39 is essential for mammalian epithelial morphogenesis through upregulation of planar cell polarity components. Communications Biology, 5(1), 378 (2022)
Kurihara K, Ito T, Sato Y, Uesugi T, Yamauchi S, Komatsu M, Saito S, Domae M, *Nishino H. Management of Nuisance Macromoths in Expressways through Academic-Industrial Collaboration: Light Trap Designed on the Basis of Moths’ Preferences for Light Attributes. Zoological Science, 39(4), 307-319 (2022)
Tateishi K, Watanabe T, Nishino H, Mizunami M, *Watanabe H. Silencing the odorant receptor co-receptor impairs olfactory reception in a sensillum-specific manner in the cockroach. iScience, 25(5), 104272 (2022)
*Saito D, Tadokoro R, Nagasaka A, Yoshino D, Teramoto T, Mizumoto K, Funamoto K., Kidokoro H, Miyata T, Tamura K, *Takahashi Y. Stiffness of primordial germ cells is required for their extravasation in avian embryos. iScience, 25(12), 104272 (2022)
*Tanaka Y, Miura H, *Tamura K, Abe G. Morphological evolution and diversity of pectoral fin skeletons in teleosts. Zoological Letters, 8, 13 (2022)
Miyamoto K, Kawakami K, Tamura K, *Abe G. Developmental independence of median fins from the larval fin fold revises their evolutionary origin. Scientific Reports, 12, 7521 (2022)
*Takeuchi T, Matsubara H, Minamitani F, Satoh Y, Tozawa S, Moriyama N, Maruyama K, Suzuki KT, Shigenobu S, Inoue T, Tamura K, Agata K, Hayashi T. Newt Hoxa13 has an essential and predominant role in digit formation during development and regeneration. Development, 149(5), dev200282 (2022)
Holz D, Hall AR, Usukura E, Yamashiro S, Watanabe N, *Vavylonis D. A mechanism with severing near barbed ends and annealing explains structure and dynamics of dendritic actin networks. eLife, 11, e69031 (2022)
山城佐和子, 渡邊直樹. ミオシン張力によるアクチン線維安定化の細胞内蛍光単分子イメージング解析. バイオクリニカ, 37(11), 1062-1066 (2022)
Takagishi M, Aleogho BM, Okumura M, Ushida K, Yamada Y, Seino Y, Fujimura S, Nakashima K, *Shindo A. Nutritional control of thyroid morphogenesis through gastrointestinal hormones. Current Biology, 32(7): 1485-1496 (2022)
Nurmahdi H, Hasegawa M, Mujizah EY, Sasamura T, Inaki M, Yamamoto S, *Yamakawa T, *Matsuno K. Notch Missense Mutations in Drosophila Reveal Functions of Specific EGF-like Repeats in Notch Folding, Trafficking, and Signaling. Biomolecules, 12(12), 1752 (2022)
*Yamakawa T, Mujizah EY, Matsuno K. Notch Signalling Under Maternal-to-Zygotic Transition. Fly, 16(1), 347-359 (2022)
*Inaki M, Matsuno K. Live imaging of delamination in Drosophila shows epithelial cell motility and invasiveness are independently regulated. Scientific Reports, 12, 16210 (2022)
Montagne K, Ngao B, Ushida T, *Furukawa KS. High Hydrostatic Pressurization of Human MSC-like Cell (YUB625) Derived from Polydactylouss Finger Cartilage as a Potential in Vitro Model for Elucidation of Osteoarthritis Pathology. Alternatives to Animal Testing and Experimentation, 27(2), 53-58 (2022)
*Montagne K, Furukawa KS, Taninaka Y, Ngao B, *Ushida T. Modulation of the long non-coding RNA Mir155hg by high, but not moderate, hydrostatic pressure in cartilage precursor cells. PLOS ONE, 17(12), e0275682 (2022)
Charoensombut N, Kawabata K, Kim J, Chang M, Kimura T, Kishida A, Ushida T, *Furukawa KS. Internal radial perfusion bioreactor promotes decellularization and recellularization of rat uterine tissue, Journal of Bioscience and Bioengineering, 133(1), 83-88 (2022)
後藤結香, 辻本敦司, 西澤誠治, 古川克子, *牛田多加志. 低周波テラヘルツ時間領域分光法による軟骨マトリクス水溶液の水分子の誘電率計測. 臨床バイオメカニクス, 43, 345-349 (2022)
浅井詢吾, 丁憲煜, 牛田多加志, *古川克子. 脱細胞化手法を用いたラット大腿骨表面にみられる微細構造の解析. 臨床バイオメカニクス, 43, 333-337 (2022)
進藤麻子. 胚発生における細胞骨格と細胞集団の協調的な運動. 生体の科学, 73(4), 295-299 (2022)
Ishibashi T, *Matsuno K. extra macrochaetae, encoding Drosophila Id, controls apical cell shape in the hindgut epithelium. microPublication Biology (2022)
Kitajima K, Kawahira N, Lee S, Tamura K, *Morishita Y, *Ohtsuka D. Light-induced local gene expression in primary chick cell culture system. Development, Growth & Differentiation, 63(3), 189-198 (2021)
Murai H, Shibuya M, Kishita R, Sunae C, Tamura K, *Saito D. Envelopment by endothelial cells initiates translocation of avian primordial germ cell into vascular tissue. Developmental Dynamics, 250(10), 1410–1419 (2021)
Yamanaka S, Murai H, Saito D, Abe G, Tokunaga E, Iwasaki T, Takahashi H, Takeda H, Suzuki T, Shibata N, Tamura K, *Sawasaki T. Thalidomide and its metabolite 5-hydroxythalidomide induce teratogenicity via the cereblon neo-substrate PLZF. The EMBO Journal, 40(4), e105375 (2021)
Shin D, Nakamura M, Morishita Y, Eiraku M, Yamakawa T, Sasamura T, *Akiyama M, *Inaki M, *Matsuno K. Collective nuclear behavior shapes bilateral nuclear symmetry for subsequent left-right asymmetric morphogenesis in Drosophila. Development, 148(18), dev198507 (2021)
Maki K, Nava MM, Villeneuve C, Chang M, Furukawa KS, Ushida T, *Wickstrom SA. Hydrostatic pressure prevents chondrocyte differentiation through heterochromatin remodeling. Journal of Cell Science, 134(2), jcs247643 (2021)
*Matsuo K, Tamura R, Hotta K, Okada M, Takeuchi A, Wu Y, Hashimoto K, Takano H, Momose A, Nishino A. Bilaterally asymmetric helical myofibrils in ascidian tadpole larvae. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 9, 800455 (2021)
*山城佐和子, 渡邊直樹. 細胞内蛍光単分子イメージングによるミオシン張力依存的なアクチン線維安定化の証明, 生体の科学, 72(3), 234−238 (2021)

＜学会発表139件＞ #

Takuma Kikuchi, Sushan Chowhan, Toshihisa Kotake, Daisuke Takahashi. Fructan accumulation is associated with changes in freezing tolerance under diurnal temperature fluctuations. 日本植物生理学会年会, 2025年3月14日, 金沢.
Momoka Ohashi, Takuma Kikuchi, Kimie Atsuzawa, Yasuko Kaneko, Toshihisa Kotake, Daisuke Takahashi. Cell wall structure of two Selaginella species with different tolerance to desiccation. 日本植物生理学会年会, 2025年3月16日, 金沢.
安藤俊哉、荒木祥文、家木壮一、松林圭、ゾウムシ鱗片細胞によるクチクラフォトニック結晶形成、令和 7 度蚕糸・昆虫機能利用学術講演会、京都工芸繊維大学、京都、3月17日、2025年
荒木祥文、安藤俊哉、松林圭、スナムグリヒョウタンゾウムシの人工飼料による累代飼育手法のさらなる検討、第69回日本応用動物昆虫学会大会、幕張メッセ国際会議場、千葉、3月21日、2025年
JST-EMBO合同シンポジウム, Global insight in life sciences: bridging European and Japanese research, 2025年2月進藤麻子
第98回日本内分泌学会,　幕張, 2025年6月　進藤麻子
第58回日本発生生物学会, 名古屋, 2025年7月　進藤麻子
Aina Kikuchi, Naho Nishigaki, Hironori Takasaki, Daisuke Takahashi, Toshihisa Kotake. Functions of atypical endo-β-1,4-mannanases in the synthesis and deposition of glucomannan. 8th International Conference on Plant Cell Wall Biology, 2024年6月18日, Santiago, Chile.
Tatsuya Kutsuno, Toshihisa Kotake, Daisuke Takahashi. Cell wall is associated with freezing tolerance and growth plasticity during cold and deacclimation. 8th International Conference on Plant Cell Wall Biology, 2024年6月18日, Santiago, Chile.
Sushan Chowhan, Tatsuya Kutsuno, Hiroto Handa, Toshihisa Kotake, Daisuke Takahashi. Soluble sugars have greater role than cell wall polysaccharides for attaining freezing tolerance in wheat. The 3rd International Wheat Congress, 2024年9月25日, Perth, Australia.
Salamander meeting 2024 in Hirishima 佐藤伸
Keratinosyte-driven collagen formation in Ambystoma mexicanum　Akira Satoh, Ayaka Ohashi　International Symposium on Morphogenesis by Non-Cellular Materials 2024年11月25日
アホロートル四肢再生の開始機構とアホロートルを利用した皮膚研究の展開　佐藤伸　山梨大学生命科学の最前線（全8回） 2024年11月15日
Induction Mechanism Of Axolotl Limb Regeneration AKIRA SATOH 7th TERMIS World Congress 2024 - Seattle, Washington. 2024年6月27日
Allometry in limb regeneration and scale-invariant patterning as a basis of normal morphogenesis from different sizes of blastemas Saya Furukawa, Yoshihiro Morishita, Akira Satoh
Limb development:Fundamental mechanisms,evolution,disease and regeneration.EMBO meeting 2024年6月19日 Akira Satoh
メキシコサラマンダー四肢再生における分化リプロミングを理解するための基盤研究佐藤伸日本再生医療学会 2024年3月22日
The Trigger Signal For Amphibian Limb Regeneration: BMP and FGF in Inducing Blastema Formation Akira Satoh 2nd virtual BMP forum 2024年3月6日
Tomoyuki Nakamura, Chisato Murabe: Identification of negative regulators of elastic fiber formation. International Symposium on Morphogenesis by Non-Cellular Materials (Nov 25, 2024, Kyoto University)
中邨智之：「呼吸器疾患における細胞外マトリックスの役割」第70回日本病理学会秋期特別総会日本肺病理学会（JPPS）コンパニオンミーティング（日本教育会館、東京、2024年11月8日）
中邨智之：「細胞外マトリックスのクロスリンクと大動脈瘤」第56回日本結合組織学会学術大会シンポジウム（つくば国際会議場、つくば、2024年6月15日）
橋村秀典, 桑名悟史, 中川日々紀, 阿部健一, 安達智子, 杉田登代子, 藤代祥子, 本田玄, 澤井哲. 「細胞性粘菌の5色蛍光ライブイメージング」　第14回日本細胞性粘菌学会例会
橋村秀典, 桑名悟史, 中川日々紀, 阿部健一, 安達智子, 杉田登代子, 藤代祥子, 本田玄, 澤井哲. 「細胞性粘菌を用いた４色蛍光ライブイメージング」　第76回日本細胞生物学会2024年7月17日
熊野岳。エダアシクラゲ触手枝分かれ機構の解析。NIBB新規モデル生物開発共同利用研究研究会、岡崎、2024年3月28日
Mako Takahashi, Shumpei Morita and Gaku Kumano. Toward understanding germline development in the hydrozoan species, Cladonema pacificum. Cnidofest 2024, Bethlehem, Pennsylvania, August 14-17, 2024.
Itakura, Y., Sun, Z., Inagaki, S., Wada, H. and Hayashi, S. Mechanical control by a compartmentalized extracellular matrix enables nano-scale patterning of insect cuticles. 57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists. Kyoto. (June. 2024) (口頭、査読有り)
荒木祥文、安藤俊哉、松林圭、人工飼料を用いたスナムグリヒョウタンゾウムシ（コウチュウ目：ゾウムシ科）の室内累代飼育、日本昆虫学会第84回大会・第68回日本応用動物昆虫学会大会合同大会、仙台国際センター、仙台市、宮城、2024年3月28日〜31日、2024年
安藤俊哉、ゾウムシ鱗片の細胞内フォトニック結晶形成の発生遺伝的基盤を理解する、第57回日本発生生物学会、みやこめっせ、京都、6月20日、2024年（招待講演）
安藤俊哉、昆虫の高効率ノックイン技術を活用して多細胞生物の表現型進化を理解する、第9回日本ゲノム編集学会、大阪市中央公会堂、大阪、6月18日、2024年
Ando T, Araki Y, Kei Matsubayashi, A developmental genetic approach to the study of cuticular photonic crystal formation in the weevil scale cell, XXVII International Congress of Entomology 2024, Kyoto Interanational Conference Center, Kyoto, Japan, August 25-30
安藤俊哉、生命が示す幾何学的機能形態の『形成』と『進化』の分子基盤を昆虫を使って理解する、第33回共生進化機構先端セミナー、オンライン、 3月18日、2024年
宮本知英、黒田純平、船山典子、上坂将弘、田村宏治. 演題：チョウザメにおける「稜鱗」形成メカニズムの解析と魚類の鰭条形成メカニズムとの比較.日本動物学会第95回長崎大会
村上天悠、吉田渓悟、田中祥貴、阿部玄武、上坂将弘、田村宏治.ヒレ内骨格再生におけるエピジェネティック因子AP-1複合体の機能.日本動物学会第95回長崎大会
坪井有寿, 藤本仰一, 近藤武史,細胞外マトリックスの時空間制御による上皮組織形態形成機構の解明, 定量生物学の会第十一回年会, 2024年1月7日　
Alice Tsuboi, Koichi Fujimoto, Takefumi Kondo, Spatio-temporal remodeling of extracellular matrix orients epithelial sheet folding, International Smposium on Mechanical control of biological self-organization, 2024年6月18日
Alice Tsuboi, Koichi Fujimoto, Takefumi Kondo, 細胞外マトリックスの時空間制御による上皮組織形態形成機構の解明, 57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2024年6月20日
Alice Tsuboi, Koichi Fujimoto, Takefumi Kondo, Spatio-temporal remodeling of extracellular matrix orients epithelial sheet folding, International Symposium on Morphogenesis by Non-Cellular Materials, 2024年11月25日
細胞内蛍光１分子可視化で捉えたTalinによる力伝達の仕組み、山城佐和子、Rutkowski DM, Lynch KA, Liu Y, Vavylonis D, 渡邊直樹、第97回日本生化学会大会シンポジウム「膜臨界場を起点とするしなやかさ生物学の創成」、横浜、2024年11月
Force transmission mechanism as revealed by live-cell single-molecule imaging、山城佐和子、第76回日本細胞生物学会大会シンポジウム「バイオ物性と細胞運命決定」、筑波、2024年7月
松尾光一（招待講演）スケールを超えたマウス頭蓋冠の左右（非）対称性. シンポジウム「運動器の進化発生生物学」第42回日本骨代謝学会学術集会2024年6月29日-7月2日（沖縄）
宇佐美心手，野路しのぶ，黒田有希子，河合克宏，松尾光一（ポスター）マウス・ハムスター・ウサギの頭蓋冠の骨梁構造の形態学. 第42回日本骨代謝学会学術集会2024年6月29日-7月2日（沖縄）
熊木勘太，野路しのぶ，河合克宏，黒田有希子，松尾光一（ポスター）ナノ CT を用いた皮質骨内管腔構造の左右（非）対称性の解析. 第42回日本骨代謝学会学術集会2024年6月29日-7月2日（沖縄）
西田浩子，大坂享史，高橋杏奈，翁慶鎧，黒田有希子，河合克宏，松尾光一（口演）　骨芽細胞株のキラリテイ分布へのシングルセルクローニングの影響．第42回日本骨代謝学会学術集会2024年6月29日-7月2日（沖縄）
翁慶鎧，河合克宏，大坂享史，黒田有希子，松尾光一（ポスター）　内臓逆位マウスの解析に向けた細胞キラリティ解析手法の開発．第42回日本骨代謝学会学術集会2024年6月29日-7月2日（沖縄）
小嶋徹也　ショウジョウバエ成虫肢の形づくりにおけるパルテノン神殿様構造とマクロファージ様細胞　第47回日本分子生物学会年会　(2024)
Hiraiwa S., Terano T., Takeshita, S., Kojima T. The mechanism of the tissue shape formation by the concerted action of the apical and basal ECM and epithelial cells. 16th Japanese Drosophila Research Conference (2024)
古川可奈, 長谷川望, 竹島源斗, 竹田宏典, 松永大樹, 出口真次；気管形成メカニズムに基づく人工気管組織創出への挑戦, 第47回日本分子生物学会年会 2024年11月（国内学会）(招待講演)
古川可奈；他種細胞間で生じる“力”を活かしたデバイス作製による人工気管組織形成への挑戦, 日本機械学会2024年度年次大会 2024年9月（国内学会）(招待講演)
1st Asian Xenopus Conference, 大阪, 2024年11月　進藤麻子
第83回アメリカ発生生物学会, アトランタ, 米国, 2024年7月　進藤麻子
The 2nd NIBB-Princeton Joint Symposium, ニュージャージー, 米国, 2024年3月　進藤麻子
第97回日本生化学会, 横浜, 2024年11月　進藤麻子
第57日本発生生物学会, 京都, 2024年6月　進藤麻子
Takuma Kikuchi, Momoka Ohashi, Yasuko Kaneko, Toshihisa Kotake, Daisuke Takahashi, Insights from a cell wall perspective into the molecular mechanisms of desiccation tolerance in Selaginella tamariscina. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, 2023年10月14日, Taipei, Taiwan.
Hiroto Handa, Mayuko Matsumoto, Megumi Miyagawa, Daisuke Takahashi, Shinya Fushinobu, Toshihisa Kotake. Distribution of UDP-glucose 4-epimerases with UDP-xylose 4-epimerase activity in plants. Taiwan-Japan Plant Biology 2023, 2023年10月14日, Taipei, Taiwan.
アホロートルの優れた筋再生能力と細胞外マトリックスの役割大蘆彩夏,佐藤伸第46回日本分子生物学会年会 2023年12月8日
アホロートル真皮内において細胞が編み出すコラーゲンの構造 Akira Satoh, Ayaka Ohashi第46回日本分子生物学会年会シンポジウム「組織構築を創出するコラーゲンの「新・動態」に迫る」 2023年12月8日
アホロートル四肢再生における多様な大きさの再生芽でのShh・Fgf8の発現領域サイズと細胞分布動態の比較解析古川彩絢, 森下喜弘, 佐藤伸第46回日本分子生物学会年会2023年12月7日
アホロートルの表皮細胞が作る真皮コラーゲン構造構築法の解明大蘆彩夏, 黒田純平, 佐藤伸第46回日本分子生物学会年会 2023年12月7日
アホロートル（Ambystoma mexicanum）の歯再生は神経依存的であり、FGFシグナルによって代替される佐藤伸第77回NPO法人日本口腔科学会学術集会2023年5月12日
中邨智之：「弾性線維再生薬の分子標的探索　〜マトリックス創薬への第一歩〜」エラスチン・関連分子研究会第8回学術集会（東北大学、仙台、2023年11月23日）
橋村秀典, 桑名悟史,安達智子, 杉田登代子, 藤代祥子, 澤井哲. 「粘菌アメーバにおけるセルロースチューブ形成」　第46回日本分子生物学会2023年12月6日
橋村秀典, 安達智子, 杉田登代子, 桑名悟史, 阿部健一,藤代祥子, 澤井哲. 「細胞性粘菌の形態形成に伴う分子局在パターンの変遷の解析」　第13回日本細胞性粘菌学会例会 2023年10月21日
第46回　日本分子生物学会Mechanical roles of extracellular matrix in mouse early morphogenesis　Yoko Ueda, Chiharu Kimura-Yoshida, Isao Matsuo　2023.12.08　Kobe シンポジウム発表
第46回　日本分子生物学会年会　子宮内圧は胚の発生に関与しているのか？奥野未鈴、上⽥陽⼦、持⽥京⼦、別所康全、⽊村ー吉⽥千春、松尾勲　2023.12.07　神戸　ポスター発表
第61回　日本生物物理学会年会The effects of intrauterine pressure by uterine smooth muscle contractions for embryos in early organogenesis stage　Misuzu Okuno, Yoko Ueda, Kyoko Mochida, Yasumasa Bessho, Chiharu Kimura-Yoshida, Isao Matsuo　2023.11.16 Nagoya Poster
第94回日本動物学会　山形大会　奥野未鈴、上田陽子、別所康全、木村−吉田千春、松尾勲　器官形成初期における胚への子宮内圧の影響　2023.09.07　山形　口頭発表
The 56th annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists　In vivo measurements of mouse intrauterine pressures and their biomechanical roles in midgestational mouse embryos. Misuzu Okuno, Yoko Ueda, Kyoko Mochida, Yasumasa Bessho, Chiharu Kimura-Yoshida, Isao Matsuo2023.7.23〜24　仙台　ポスター
The 56th annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists USP39 is essential for mammalian epithelial morphogenesis through upregulation of planar cell polarity components. Chiharu Kmura-Yoshida, Kyoko Mochida, Shin-Ichiro Kanno, Isao Matsuo2023.07.23〜24　仙台　ポスター
第11回　Tokyo Vertebrate morphology meeting器官形成初期胚へかかる子宮内圧の影響奥野未鈴、上田陽子、別所康全、木村−吉田千春、松尾勲2023 7.15東京　ポスター
第126回日本小児科学会学術集会木村‐吉田　千春, 持田　京子，菅野新一郎, 松尾　勲「神経管閉鎖に働く特異な表皮細胞を誘導する新規因子の探索」2023.4.15 東京　ポスター
第46回　日本分子生物学会年会　2023.12 神戸細胞外基質がショウジョウバエ後腸の左右非対称な形態形成を制御するExtracellular matrix controls the left-right asymmetric morphogenesis of Drosophila hindgut 稲木美紀子1 須志田隆道2 秋山正和3 井上康博4 松野健治1(1. 阪大‧院理‧生物科学 2. サレジオ高専 3. 富山大‧理‧数学 4. 京大‧院工‧マイクロエンジニアリング )
第56回　日本発生生物学会大会　2023.7　仙台Extracellular matrix controls the left-right asymmetric morphogenesis of Drosophila hindgut *Mikiko Inaki1, Kenji Matsuno1 (1. Osaka Univ.)
Itakura, Y., Sun, Z., Inagaki, S., Wada, H. and Hayashi, S. Nano-scale　patterning of insect cuticle by a structured extracellular matrix with compression force. 56th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists. Sendai. (July. 2023) (口頭、査読有り)
安藤俊哉、荒木祥文、家木壮一、松林圭、ゾウムシ鱗片の構造色発色性フォトニック結晶の種内多型に着目した分子遺伝学的アプローチ、日本動物学会第94回大会、山形大学小白川キャンパス、山形市、山形、2023年9月7日
岡山舜、上坂将弘、阿部玄武、森下喜弘、田村宏治.魚類胸鰭特異的な構造形成時の細胞動態.第46回日本分子生物学会年会
工藤栄大、上坂将弘、牧野能士、田村宏治.四肢発生に関わる四足動物特異的な保存ゲノム配列の探索と解析.第46回日本分子生物学会年会
宮本知英、黒田純平、阿部玄武、田村宏治.ゼブラフィッシュ正中鰭に見られる棘条の祖先形質.日本動物学会第94回山形大会
吉田渓悟、阿部玄武、上坂将弘、田村宏治.ゼブラフィッシュ胸ヒレ内骨格の再生能力に対するmmp の関与.日本動物学会第94回山形大会
宮本知英、黒田純平、阿部玄武、笹野泰之、上村了美、安齋賢、船山典子、近藤滋、田村宏治. Unique bone morphogenesis of spiny ray in acanthomorpha fish. (棘型類で見られる「棘条」に特有な骨形成メカニズム).第56回日本発生生物学会年会
岡山舜、上坂将弘、森下喜弘、阿部玄武、田村宏治. Quantitative analysis of cell behavior during the fin-specific developmental event by 3D time-lapse imaging at the single-cell level. (ヒレ形成特異的な上皮細胞動態の１細胞レベル定量解析).第56回日本発生生物学会年会
Alice Tsuboi, Koichi Fujimoto, Takefumi Kondo, 細胞外マトリックスの時空間制御による上皮組織形態形成機構の解明, 第56回日本発生生物学会, 2023年7月23日
坪井有寿, 藤本仰一, 近藤武史, 細胞外マトリックスの時空間制御による上皮組織形態形成機構の解明, 第46回日本分子生物学会, 2023年12月6日
Alice Tsuboi, Koichi Fujimoto, Takefumi Kondo, Spatio-temporal remodeling of extracellular matrix orients epithelial sheet folding, Alice Tsuboi, Koichi Fujimoto, Takefumi Kondo, Women and Future in Science 2023年12月11日
Force transmission via dynamic stretching of Talin as revealed by live-cell single-molecule imaging. Yamashiro S, Rutkowski DM, Lynch KA, Liu Y, Vavylonis D, Watanabe N. American Physical Society March Meeting、（英語）、招待講演、2023年 3月、アメリカ、ラスベガス
細胞内蛍光単分子イメージングで明らかにする流動力伝達の仕組み、山城佐和子、渡邊直樹、第46回日本分子生物学会年会シンポジウム「細胞突起の形成機構と新たな機能」、神戸、2023年12月
蛍光単分子イメージングで明らかにする細胞内力伝達機構、山城佐和子、Rutkowski DM, Lynch KA, Liu Y, Vavylonis D, 渡邊直樹、第61回日本生物物理学会年会シンポジウム「自発と応答の情報物理学」、愛知、2023年11月
松尾光一，宇佐美心手，田口育武，宮本諭，黒田有希子，野路しのぶ，百生敦，吉田光輝，尾上弘晃，河合克宏（ポスター）　骨芽細胞キラリティを反映する頭蓋冠と腓骨の微細形態. 第41回日本骨代謝学会学術集会2023年7月27-29日（東京）
河合克宏，黒田有希子，松尾光一（口演）　石灰化軟骨バイオミメティクによる骨形成促進表面の開発. 第41回日本骨代謝学会学術集会2023年7月27-29日（東京）
竹下俊平、平岩祥太朗、小嶋徹也　ショウジョウバエ成虫肢の最終形態の形成に関わるオートファジーの役割　第46回日本分子生物学会年会　(2023)
寺野天掌、平岩祥太朗、小嶋徹也　ショウジョウバエ成虫肢の最終形態の形成に関わる基底膜の役割　第46回日本分子生物学会年会　(2023)
Hiraiwa S., Terano T., Takeshita S., Kojima T. Live Imaging Analysis of Cellular Live Imaging Analysis and ECM Dynamics in the Final Shape Formation of Drosophila Adult Leg. Asia Pacific Drosophila Research Conference 6 (2023)
小林優太, 古川可奈, 松永大樹, 出口真次；実験および数理の融合による気管軟骨組織形成メカニズムの研究, 第34回バイオフロンティア講演会 2023年12月（国内学会）
竹島源斗, 古川可奈, 長谷川望, 竹田宏典, 松永大樹, 出口真次；気管軟骨の“形”を生む気管間充織細胞の凝集メカニズムの解明, 第46回日本分子生物学会年会 2023年12月（国内学会）
Kana Furukawa、Solving the Mystery of Tracheal Cartilage “Patterns” and “Shapes”, The 61th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2023年11月（国内学会）(招待講演)
古川可奈、輪状軟骨の“パターン”と“形”を生み出す謎を解く。第35回バイオエンジニアリング講演会　2023年6月（国内学会）(招待講演)
古川可奈、輪状軟骨の"パターン"と"形"を生み出す謎を解く、第7回メカノバイオロジー学会総会、2023年3月30日（国内学会）
第19回International Xenopus Conference, メリーランド, 米国, 2023年8月　進藤麻子
第46回日本分子生物学会, 神戸, 2023年12月　進藤麻子
第47回日本比較内分泌学会, 福岡, 2023年11月　進藤麻子
第23回日本動物学会, 山形, 2023年9月　進藤麻子
第75回日本細胞生物学会, 奈良, 2023年6月　進藤麻子
第128回日本解剖学会, 仙台, 2023年3月　進藤麻子
第45回日本分子生物学会年会 MBSJ2022木村‐吉田　千春, 持田　京子，菅野新一郎, 松尾　勲「哺乳動物の上皮形成過程において、脱ユビキチン酵素 USP39因子は平面内極性（PCP経路）構成因子を活性化することで機能する」2022.12.01千葉　幕張ポスター
熊野岳。エダアシクラゲ触手枝分かれ機構の解析。NIBB新規モデル生物開発共同利用研究ミニシンポジウム、岡崎、2022年11月15日
高橋真湖、森田俊平、熊野岳。エダアシクラゲにおける生殖細胞形成機構の解析。日本分子生物学会第45回大会、幕張、2022年11月30日～12月2日
Shiting Hou, Akiyo Fujiki, Saki Shibata, Ayaki Nakamoto and Gaku Kumano. Branching morphogenesis of medusa tentacles in the jellyfish species Cladonema pacificum. Tohoku University-OIST 3rd Joint Workshop on Biodiversity, Sendai, October 24-26, 2022.
Shiting Hou, Akiyo Fujiki, Ayaki Nakamoto and Gaku Kumano. Branching morphogenesis of Cladonema medusa tentacles. Cnidofest 2022, Davis, California, September 7-10, 2022.
西野浩史　昆虫の聴覚器-比較研究からみえてきた動作原理と進化-　日本動物学会第93回大会 S14シンポジウム「バイオミメティクスからエコミメティクスへ」東京、早稲田大学（2022）
Takanashi T, Yasa J, Sekine T, Oe T, Skals N, Onodera R, Abe S, Koike T, Nishino H. Exploitation of vibration sensing for pest control in whiteflies on tomatoes. 第９回生物音響学会年次研究発表会（小田原、国際医療福祉大学）(2022)
Takanashi T., Skals N., Sekine T., Yase J., Ohya T., Onodera R., Nishino H, Koike T. Exploitation of vibration sensing for pest management in whiteflies. 3rd Biotremology Conference (Piran, Slovenia) (2022)
立石康介、渡邊崇之、西野浩史、水波誠、渡邉英博ワモンゴキブリの2種の性フェロモンの受容機構と行動的役割の違い日本動物学会第93回大会（東京、早稲田大学）(2022)
宮本知英、川上浩一、田村宏治、阿部玄武.細胞動態の記載から考える真骨魚類の新たな正中ヒレ形成モデル.日本動物学会第93回早稲田大会
岡山舜、阿部玄武、田村宏治.胸鰭AER/AF 転換時の細胞動態.日本動物学会第93回早稲田大会
工藤栄大、米井小百合、牧野能士、阿部玄武、田村宏治.四足動物特異的な保存ゲノム配列の解析.日本動物学会第93回早稲田大会
吉田渓悟、阿部玄武、田村宏治.ゼブラフィッシュ胸ヒレ内骨格の再生不全を引き起こす因子の解析.日本動物学会第93回早稲田大会
田中祥貴、安齋賢、阿部玄武、田村宏治.真骨魚類の対ビレにおけるShh遺伝子の機能分化とそこから生じる形態進化の可能性.日本動物学会第93回早稲田大会
工藤栄大、米井小百合、阿部玄武、牧野能士、田村宏治.魚類特異的遺伝子のヒレ発生における役割の解析.日本動物学会令和4年度東北支部大会
田中祥貴、安齋賢、阿部玄武、田村宏治.真骨魚類の対ビレにおけるShh遺伝子の機能分化とそこから生じる形態進化の可能性.日本進化学会年大会第24回沼津大会
蛍光単分子イメージングで明らかにする流動力伝達の仕組み、山城佐和子、第10回定量生物の会、広島、2022年12月
細胞内蛍光単分子イメージングによるアクチン線維流動力伝達機構の解明、山城佐和子、第11回分子モーター討論会、大阪、2022年11月
第45回日本分子生物学会, 幕張, 2022年12月　進藤麻子
第95回日本生化学会, 名古屋, 2022年11月　進藤麻子
第22回日本動物学会, 早稲田, 2022年9月　進藤麻子
第1回International Symposium Jointly Organized by JSDB and SDBS, Multi-scale Patterning in Development,オンライン, 2022年4月　進藤麻子
第44回日本分子生物学会年会 MBSJ2021Isao Matsuo, Chiharu Kimura-Yoshida, Yoko Ueda Intrauterine pressures cushioned by Reichert’s membrane are crucial for early mouse morphogenesis 2021.12.02 Yokohamaシンポジウム発表
第44回日本分子生物学会年会 MBSJ2021爪　麻美, 木村‐吉田　千春, 持田　京子，上田　陽子, 松尾　勲BETファミリータンパク質はマウス着床前胚においてエピブラスト系譜の特異化と維持に必要である2021.12.02 Yokohama ポスター　オンライン　　
Mechanical role of Reichert’s membrane for early mouse morphogenesis in utero.Yoko Ueda, Chiharu Kimura-Yoshida, Kyoko Mochida, Mami Tsume, Ryuji Hiramatsu, Isao Matsuo 54th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists　2021.6.16　 online　ポスター発表
Hou Shiting、藤木聡世、Jianrong Zhu、柴田紗希、中本章貴、熊野岳。二胚葉性動物における形づくり：エダアシクラゲの触手枝分かれ機構。日本動物学会第92回富山大会、米子オンライン、2021年9月2～4日。
Hou, S., Jiangrong Z., Shibata, S., Nakamoto, A. and Kumano, G. Periodic accumulation of interstitial cells generates the branched architecture of Cladonema medusa tentacles. 54th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, Zoom online, June 17-18, 2021.
宮本知英、阿部玄武、田村宏治.正中ヒレは fin-fold からの削り出しではなく原基の伸長により作り出される.日本動物学会・令和3年度東北支部大会
宮本知英、川上浩一、阿部玄武、田村宏治. Emergence of the median fin is owing to the primordia elongation rather than the carving out of the larval median fin fold. (正中ヒレは fin-fold からの削り出しではなく原基の伸長により作り出される).第54回日本発生生物学会年会
吉田渓悟、阿部玄武、田村宏治.ゼブラフィッシュ胸ヒレ内骨格が再生できない原因の探索と解明.第92回日本動物学会オンライン米子大会
田中祥貴、安齋賢、阿部玄武、田村宏治.ゼブラフィッシュ胸ビレのShh-Hox遺伝子群発現から　考える条鰭類胸ビレ骨格形態進化.第92回日本動物学会オンライン米子大会
田中祥貴、安齋賢、阿部玄武、田村宏治.真骨魚類の胸ビレ骨格における発生制御遺伝子の冗長性とその形態進化への寄与について.日本進化学会第23回東京大会
第44回日本分子生物学会, 横浜, 2021年12月　進藤麻子
第94回日本生化学会, オンライン, 2021年11月　進藤麻子
第73回日本細胞生物学会, オンライン, 2021年6月　進藤麻子
第54回日本発生生物学会, オンライン, 2021年6月　進藤麻子

＜書籍7件＞ #

西野浩史. 3.3 昆虫の振動・聴覚器の構造と機能.「昆虫工学」第１部, コロナ社 (2025) (in press)
Fujimori T, Hashimura H, *Sawai S. Imaging-Based Analysis of Cell-Cell Contact-Dependent Migration in Dictyostelium. In: Beta C, Martinez-Torres C (eds) Cell Motility and Chemotaxis. Methods in Molecular Biology, 2828, Humana, New York, NY, 23-26 (2024)
*Miyata T. Mechanical and Physical Interactions Involving Neocortical Progenitor Cells. In: Huttner W (Ed.), Neocortical Neurogenesis in Development and Evolution. Wiley, 119-136 (2023)
*Takanashi T, *Nishino H. Exploitation of Vibration Sensing for Pest Management in Longicorn Beetles. In: Hill, PSM, Mazzoni V, Stritih-Peljhan N, Virant-Doberlet M, Wessel A (eds), Biotremology: Physiology, Ecology, and Evolution. Animal Signals and Communication, vol 8. Springer, Cham, 495-509 (2022)
田村宏治. 進化の謎をとく発生学：恐竜も鳥エンハンサーを使っていたか. 岩波ジュニア新書, 岩波書店（2022）
西野浩史. 12.3 コオロギの耳：最小・高感度・広帯域の聴覚器. 「最先端コオロギ学 ~ 世界初! 新しい生物学がここにある ~」野地澄晴編, 北隆館, 182-185 (2022)
西野浩史. 13.3 死にまね. 「最先端コオロギ学 ~ 世界初! 新しい生物学がここにある ~」野地澄晴編, 北隆館, 191-193 (2022)

＜主催シンポジウム10件＞ #

大阪大学蛋白質研究所セミナー　松野健治シンポジュウム・タイトル：深化するNotchシグナル研究日時：2025 年 3 月 16 日（日）13：00-19：30 会場：大阪大学理学研究科南部洋一郎ホール（大阪大学豊中キャンパス） https://www.sci.osaka-u.ac.jp/ja/nambu-hall/#access
第47回分子生物学会シンポジウム「流動研究の最前線−物理学と生物学の融合」、2024年11月、福岡山城　佐和子
オーガナイザー: Shigeo Hayashi, Bernard Moussian, Toshiya Ando Symposium 6-3 “Insect cuticles: morphogenesis and physiological functions”, XXVII International Congress of Entomology, Kyoto International Conference Center, 26-30 Aug., 2024
1st Asian Xenopus Conference, 大阪, 2024年11月　進藤麻子
第47回分子生物学会　フォーラム　「マクロファージ新機能探訪」稲木　美紀子
第46回分子生物学会　シンポジウム「細胞外基質のダイナミクスによる形態形成とホメオスタシス」稲木　美紀子
第75回日本細胞生物学会シンポジウム「メカノバイオロジー研究で迫る細胞−微小環境の相互作用」、2023年6月、奈良山城　佐和子
第45回分子生物学会年会　ワークショップ主催　2022年12月1日「細胞外環境を起点とした力による形態形成」稲木美紀子
Institute for Protein Research (IPR) International Seminar シンポジュウム・タイトル：Towards controlling the Notch signaling pathway Date: Tuesday, January 18th, 2022 (Online) オーガナイザー：松野健治（阪大・理学研究科）、竹内英之 (静岡県大・薬)、高木淳一（阪大・蛋白研）
第44回分子生物学会ワークショップ「細胞骨格・細胞運動研究のフロンティア」、2021年12月、横浜山城　佐和子

研究項目A02 #

計画研究 #

＜発表論文14 件＞ #

*Weng S, Hayashi M, Inoue Y, *Wallingford JB. Planar polarized force propagation integrates cell behavior with tissue shaping during convergent extension. Current Biology, 35(1): 1-10.e3 (2025)
Sato S, *Sakashita M, Kagami R, Wada N. Air-liquid interface culture for live analysis of zebrafish vertebral growth, microPublication Biology (2025)
*坂下美咲. 硬骨魚類の椎体側面における構造の発達と骨髄腔の形成. 日本骨形態計測学会雑誌, 34(2), 72-73 (2024)
*Sakashita M, Kondo S, Wada N. Lateral bone ridge expansion and internal tissue replacement for vertebral body growth in Pacific bluefin tuna Thunnus orientalis, Journal of Morphology, 285(2), e21666 (2024)
Kametani H, Tong Y, Shimada A, *Takeda H, *Sushida T, *Akiyama M, *Kawanishi T. Twisted cell flow facilitates three-dimensional somite morphogenesis in zebrafish. Cells & Development, 180, 203969 (2024)
*Morikawa K, *Inoue Y. Computational mechanics simulations on epithelial folding (Strengths, insights, and future challenges). Journal of Biomechanical Science and Engineering, 19(2), 23-00562 (2024)
*Morikawa K, Morita S, Sakura K, Maeno A, Gotoh H, Niimi T, *Inoue Y. Unveiling the role of differential growth in 3D morphogenesis: An inference method to analyze area expansion rate distribution in biological systems. Journal of Theoretical Biology, 575, 111650 (2024)
*井上康博. 形態形成を表す多細胞動力学の数理モデル, 応用数理, 33(3), 133-140 (2023)
*Mimura T, *Inoue Y, Cell-center-based model for simulating three-dimensional monolayer tissue deformation, Journal of Theoretical Biology, 571, 111560 (2023)
Kinoshita A, Naito M, Wang Z, Inoue Y, Mochizuki A, *Tsukaya H, Position of meristems and the angles of the cell division plane regulate the uniqueness of lateral organ shape, Development, 149(23), dev199773 (2022)
*Morikawa K, Kuroda D, *Inoue Y. Impact of environmental asymmetry on epithelial morphogenesis, Scientific Reports, 12(1), 11326 (2022)
Ayukawa T, Akiyama M, Hozumi Y, Ishimoto K, Sasaki J, Senoo H, Sasaki T, *Yamazaki M. Tissue flow regulates planar cell polarity independently of the Frizzled core pathway. Cell Reports, 40(12), 111388 (2022)
*Hayashi T, Tomomizu T, Sushida T, Akiyama M, Ei SI, *Sato M. Tiling mechanisms of the Drosophila compound eye through geometrical tessellation. Current Biology, 32(9), 2101-2109.e5 (2022)
*Sakashita M, Yamasaki S, Yaji K, Kawamoto A, Kondo S. Three-dimensional topology optimization model to simulate the external shapes of bone, PLOS Computational Biology, 17(6), e1009043 (2021)

＜学会発表72件＞ #

Chang Z. and Yamasaki S., Multilevel optimization and simulation: Designing innovative vascular stent utilize tensegrity structure. the 16th World Congress on Structural and Multidisciplinary Optimization, Kobe Japan, May 2025. (Accepted)
Wang L., Yang L., Sakashita M., Yamasaki S., A framework for predicting loading forces applied on fish vertebrae based on topology optimization and deep neural network. the 16th World Congress on Structural and Multidisciplinary Optimization, Kobe Japan, May 2025. (Accepted)
各務遼、永井優汰、坂下美咲、和田直之、ゼブラフィッシュ椎骨の形態の発達における骨芽細胞と破骨細胞の活動、日本動物学会関東支部第77回大会、産業技術総合研究所つくば中央共用講堂、2025年3月（ポスター）
Mimura T., Inoue Y., A Three-Dimensional Morphogenesis Simulation of Epithelial Monolayers Using a Cell-Centered Model, APS Global Physics Summit 2025, Anaheim CA, 2025 (Oral)
Morikawa K., Morita S., Sakura K., Maeno A., Gotoh H., Niimi T., Inoue Y., A Method for Inferring Differential Growth Rate Distributions in 3D Surface Morphogenesis Using Conformal Maps, APS Global Physics Summit 2025, Anaheim CA, 2025 (Oral)
Inoue Y., Morikawa K., Environmental Asymmetry Shapes Folding in Growing Epithelial Tissues, 4th International Workshops on Advances in Computational Mechanics, 2024 (Invited)
Matsuda K., Inoue Y., Adachi H., Gotoh H., Kondo S., Understanding beetle horn morphogenesis through computer simulations, 4th International Workshops on Advances in Computational Mechanics, 2024 (Invited)
Morikawa K., Inoue Y., An Analytical Method for Curved Surface Morphogenesis and Its Application in Fabrication, 4th International Workshops on Advances in Computational Mechanics, 2024 (Invited)
Morikawa K., Morita S., Sakura K., Maeno A., Gotoh H., Niimi T., Inoue Y., Analysis of Differential Growth in Curved Surface Morphogenesis through Constructing a Conformal Map, International Union for Pure and Applied Biophysics 2024, 2024 (Oral)
Mimura T., Inoue Y., Simulating three dimensional epithelial monolayer tissue deformation using cell center model, International Union for Pure and Applied Biophysics 2024, 2024 (Poster)
Inoue Y., Morikawa K., The Role of Environmental Asymmetry in Epithelial Tissue, International Union for Pure and Applied Biophysics 2024 (Sponsored Symposium 1), 2024 (Invited)
Yasuhiro Inoue, Mathematical Modeling and Analysis of Multicellular Dynamics in Morphogenesis, 第3回 ASHBi 数理ヒト生物学研究会 (MathHuB 2024), 2024（基調講演）
三村知広, 井上康博, 細胞中心モデルを用いた平面上皮組織における曲げエネルギー散逸化手法の検討, 日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, 2024 (ポスター)
森川健太郎, 中村拓未, 松本嘉彦, 松田圭佑, 秋山正和, 山﨑慎太郎, 近藤滋, 井上康博, 生物の偏差成長の原理に学ぶ曲面構造の物理的造形手法, 日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, 2024 (ポスター)
井上康博, 生物に学ぶ3D変身技術, 日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, 2024
井上康博, 鱗を介した生物の形態形成に成立する数学的定理, 日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, 2024年
國西海渡, 三村知広, 井上康博, 球殻上皮組織の細胞分裂による極圏パターン形成, 日本機械学会第35回バイオフロンティア講演会, 2024年
Sakashita M., Wada N., Does the caudal oscillation of the thunniform swimming mode induce elongation of the caudal vertebrae and extension of the lateral ridges?, 9th International Symposium on Aero Aqua Bio-Mechanisms ISABMEC 2024, Nov. 2024, Bangkok (Oral)
Chang Z. and Yamasaki S., Innovative vascular stent design utilizing tensegrity structure. the 18th International Collaboration Symposium on Information, Production, and Systems, Kitakyushu Japan, November 2024. (Poster)
坂下美咲、和田直之、“クロマグロ椎骨の成長に伴う側面構造の発達と骨髄腔の形成”、第44回日本骨形態計測学会、コラッセふくしま、2024年6月（口頭）若手研究者賞受賞（大学HPに掲載済）
坂下美咲、“魚類椎骨の3次元形態を構成する微細構造の外力依存的な制御”、日本動物学会第95回長崎大会、長崎大学、2024年9月(招待)
竹田晴、坂下美咲、和田直之、マウス椎骨の海綿骨形成過程における軟骨内骨化及び骨モデリングの記載、日本動物学会第95回長崎大会、長崎大学、2024年9月（口頭）
永井優汰、坂下美咲、和田直之、ゼブラフィッシュ椎骨の骨芽細胞分布制御におけるコラーゲン線維配向の役割、日本動物学会第95回長崎大会、長崎大学、2024年9月（口頭）
佐藤信、永井優汰、和田直之、坂下美咲、魚類椎骨の形態形成を説明する荷重依存的な繊維配向化の数理モデリングとトポロジカル欠陥の解析、2024年度日本数理生物学会年会、北海道大学、2024年9月（ポスター）
竹田晴、坂下美咲、和田直之、“マウス椎骨の海綿骨形成初期の漸進的な軟骨置換と骨モデリング”、公益財団法人日本動物学会第76回関東支部大会、東京大学本郷キャンパス伊藤国際学術研究センター、2024年3月（ポスター）
山田祐嗣、坂下美咲、松尾光一、和田直之、“ゼブラフィッシュ椎骨における局所的な荷重の付加による形態変化”、公益財団法人日本動物学会第76回関東支部大会、東京大学本郷キャンパス伊藤国際学術研究センター、2024年3月（ポスター）
佐藤信、坂下美咲、和田直之、“魚類脊椎の培養系を用いた細胞動態と形態形成の相関解析”、公益財団法人日本動物学会第76回関東支部大会、東京大学本郷キャンパス伊藤国際学術研究センター、2024年3月（ポスター）
永井優汰、坂下美咲、和田直之、“魚類椎骨における骨付加の方向制御とコラーゲン線維配向の関連”、公益財団法人日本動物学会第76回関東支部大会、東京大学本郷キャンパス伊藤国際学術研究センター、2024年3月（ポスター）【優秀発表賞受賞】
A three-dimensional vertex dynamics model for understanding the twisting phenomenon of the hindgut of Drosophila,秋山正和(富山大学),須志田隆道(福知山公立大学),稲木美紀子(大阪大学),松野健治(大阪大学),第4回IWACOM,北九州国際会議場,2024/9/20(招待講演）
細胞シートから構築される昆虫の外骨格の数理モデル,秋山正和(富山大学),大澤志津江(名古屋大学),日向千草(名古屋大学),小林亮(広島大学),2024年度数理生物学会年会,北海道大学学術交流会館,2024/9/12(口頭発表）
坂下美咲、“脊椎の形態多様性と外力の関連を理解する数理・実験の協働的アプローチの構築”、日本機械学会第35回バイオエンジニアリング講演会、日立システムズホール仙台、2023年6月(招待)
Sakashita M., Kondo S., Yamasaki S., Wada N., Shape diversification of spine in bony fish by adaptation to mechanical forces, ICVM2023 International Congress of Vertebrate Morphology, Cairns Australia, July 2023 (Oral)
Yang L., Sakashita M., Yamasaki S., Lording force prediction for fish vertebrae based on topology optimization and deep learning, the 17th International Collaboration Symposium on Information, Production, and Systems, Kitakyushu Japan, November 2023. (Oral) Best Presentation Award
Inoue Y., Multicellular dynamics simulation for understanding epithelial tissue morphogenesis, Africa International Biomedical and Biotechnology Conference, 2023（招待講演）
Mimura T., Inoue Y., Cell-Centered Dynamics Simulation of Three-Dimensional Epithelial Sheet Deformation, 12th Asian-Pacific Conference on Biomechanics, 2023
Morikawa K., Morita S., Sakura K., Maeno A., Gotoh H., Niimi T., Inoue Y., Inference of Area Expansion Rate Distribution in 3D Sheet Morphogenesis, 12th Asian-Pacific Conference on Biomechanics, 2023
Inoue Y., Introduction to Material properties determine body shapes and their constructions, EMBO Workshop TSB Satellite Meeting, 2023（招待講演）
井上康博, 三村知広, 細胞重心運動に基づく3次元形態形成の数理モデル, 第35回バイオエンジニアリング講演会, 2023年
森川健太郎, 森田慎一, 森田慎一, 左倉和喜, 左倉和喜, 前野哲輝, 後藤寛貴, 新美輝幸, 井上康博, 幾何学からみた生物の曲面形態形成の解析手法, 日本数理生物学会年会2023, 2023年（招待講演）
林将也, 井上康博, 森川健太郎, 三村知広, 棒状要素モデルによるブーリガン構造の回転積層メカニズムの検討, 第33回バイオフロンティア講演会, 2023年
三村知広, 井上康博, 細胞中心モデルにおける曲率・ネルギー離散化手法の比較, 第33回バイオフロンティア講演会, 2023年
大住翔平, 坪井有寿, 井上康博, 卵割ジョウジョウバエ翅の折りたたみ過程の数理モデリング, 第33回バイオフロンティア講演会, 2023年
中村拓未, 森川健太郎, 林将也, 松本嘉彦, 松田圭佑, 秋田佳祐, 秋山正和, 山﨑慎太郎, 近藤滋, 井上康博, 生物の曲面形態形成に学ぶシート材料への面積変化率の実装, 第33回バイオフロンティア講演会, 2023年
五十嵐康祐, 森川健太郎, 井上康博, グラフ理論を利用したBoolean Networkの安定ノードの計算, 第33回バイオフロンティア講演会, 2023年
池田夏晶, 森川健太郎, 斉藤稔, 井上康博, 上皮組織の皺形成の背後にある位相欠陥による数学的制限, 第33回バイオフロンティア講演会, 2023年
林将也, 三村知広, 森川健太郎, 井上康博, 生物にあらわれるブーリガン構造の棒状要素モデル, 第35回バイオエンジニアリング講演会, 2023年
池田夏晶, 森川健太郎, 斉藤稔, 井上康博, トーラス上の上皮皺形成におけるトポロジカル欠陥のダイナミクス, 第35回バイオエンジニアリング講演会, 2023年
五十嵐康祐, 森川健太郎, 井上康博, Feedback Vertex Setと振動領域に着目したBoolean Networkの低次元化手法, 第35回バイオエンジニアリング講演会, 2023年
三村知広, 井上康博, 形態形成の理解に向けた細胞中心モデルの構築, 第35回バイオエンジニアリング講演会, 2023年
森川健太郎, 斉藤稔, 井上康博, 展開して曲面形状となる織構造の生成手法の開発, 第35回バイオエンジニアリング講演会, 2023年
山田祐嗣，坂下美咲，和田直之、“力的な負荷の操作がゼブラフィッシュ椎骨の形態に及ぼす影響”、日本動物学会第94回山形大会、山形大学・小白川キャンパス、2023年9月（口頭）
佐藤信、坂下美咲、和田直之、“ゼブラフィッシュ脊椎の培養系構築による形態形成の解析”、日本動物学会第94回山形大会、山形大学・小白川キャンパス、2023年9月（口頭）
A three-dimensional vertex dynamics model for understanding the twisting phenomenon of the hindgut of Drosophila,秋山正和(富山大学),RIMS研究集会「非線形現象に対する複合的研究：モデリング・数理解析・応用」RIMS Conference Multidisciplinary Research on Nonlinear Phenomena: Modeling， Analysis and Applications,京都大学益川ホール,2023/11/10(招待講演)
数学から⾒たVertex Dynamics Model,秋山正和(富山大学),2023年度日本数理生物学会年会,奈良女子大学,2023/9/4(シンポジウム主催)
生物の形づくりを探る,秋山正和(富山大学),須志田隆道(サレジオ工業高等専門学校),稲木美紀子(大阪大学),松野健治(大阪大学),第128回日本解剖学会総会・全国学術集会,東北大学川内北キャンパス,2023/3/19(招待講演)
Morikawa K., Morita S., Sakura K., Gotoh H., Niimi T., Inoue Y., Estimation of the distribution of area expansion rates in epithelial morphogenesis with Markov chain Monte Carlo methods, 9th World Congress of Biomechanics, 2022（国際学会）
Ueda K., Morikawa K., Morita S., Sakura K., Gotoh H., Niimi T., Inoue Y., Effect of adhesion points and area changes on epithelial morphogenesis, 9th World Congress of Biomechanics, 2022（国際学会）
Shimooka Y., Akiyama M., Funayama N., Inoue Y., Three-dimensional simulation on skeletal frame formation of the sponge body, 9th World Congress of Biomechanics, 2022（国際学会）
Morikawa K., Kuroda D., Inoue Y., 物理的環境の非対称性が上皮折り畳みパターン選択に果たす役割, 第60回日本生物物理学会年会, 2022年
Mimura T., Inoue Y., 3次元形態形成を表す隣接細胞間ネットワークモデル, 第60回日本生物物理学会年会, 2022年
森川健太郎, 黒田大地, 井上康博, 非対称な物理的環境における上皮折り畳みシミュレーション, 日本機械学会第34回バイオエンジニアリング講演会, 2022年
森川健太郎, 森田慎一, 左倉和喜, 後藤寛貴, 新美輝幸, 井上康博, 調和写像法を用いた上皮形態形成における面積拡大率分布の推定, 日本機械学会第33回バイオフロンティア講演会, 2022年（招待講演）
坂下美咲、和田直之、“外力依存的な細胞活動を模した数理モデルによるゼブラフィッシュ椎骨の形態再現”、第8回ゼブラフィッシュ・メダカ創薬研究会、青山学院大学青山キャンパス、2022年11月（口頭）
坂下美咲、近藤滋、和田直之、“クロマグロ椎骨の骨吸収による形態形成と外力の関連の推定”、日本動物学会第93回早稲田大会、早稲田大学、2022年9月（口頭）
佐藤信、坂下美咲、和田直之、“ゼブラフィッシュ椎骨の形態形成を解析するための器官培養系の構築”、第8回ゼブラフィッシュ・メダカ創薬研究会、青山学院大学青山キャンパス、2022年11月（口頭）
Sakakibara M., Inoue Y., Simulation on phase propagation of gene expression oscillation focusing on cell shape, The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics, 2021（国際学会）
榊原雅人, 井上康博, 細胞形状に着目した遺伝子発現振動の位相伝播シミュレーション, 日本機械学会第33回バイオエンジニアリング講演会, 2021年
森川健太郎, 森田慎一, 左倉和喜, 後藤寛貴, 新美輝幸, 井上康博, 三次元形態形成における上皮細胞シートの面積拡大率分布の推定手法の開発, 日本機械学会第34回バイオフロンティア講演会, 2022年
Tiling mechanisms of the compound eye through geometrical tessellation,秋山正和(明治大学)他,第54回日本発生生物学会年会,オンライン開催，2021/6/17-2021/6/18(口頭発表・共著)
生物の左右性形成に関する数理的研究について,秋山正和(明治大学),2021年度数学会秋季総合分科会の応用数学分科会特別講演,オンライン開催，2021/9/16-2021/9/17(シンポジウム主催)
フェーズフィールド法によるカイメンの形の表現方法,秋山正和(明治大学),日本数理生物学会年会,宮崎大学木花キャンパスオンライン，2021/9/13-2021/9/15(招待講演)
“A three-dimensional vertex dynamics model for understanding the twisting phenomenon of the hindgut of Drosophila”,Masakazu Akiyama(明治大学),Takamichi SUSHIDA (サレジオ高専), Mikiko INAKI(大阪大学), Kenji MATSUNO(大阪大学),Society for Mathematical Biology Annual Conference (June 2021),オンライン開催，2021/6/13-2021/6/17(招待講演)

＜主催シンポジウム等8件＞ #

IWACOM-IV, *Yamasaki S, Takezawa A, Isakari H, Hoshiba H, OW2: Advances in structural and multidisciplinary optimization 2024年9月18-20日山﨑
International Union for Pure and Applied Biophysics (IUPAB) 2024 Sponsored Symposium “Physics and Mechanobiology in Cellular and Extracellular Systems” 2024年6月25日井上
日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会オーガナイズドセッション「生物の形づくりのプロセスから学ぶ工学展開」 2024年5月11日井上
日本機械学会第35回バイオエンジニアリング講演会オーガナイズドセッション「非細胞素材の加工による形態形成」 2023年6月4日井上
生物の形づくりを探る,秋山正和(富山大学),山崎正和(秋田大学),第128回日本解剖学会総会・全国学術集会,東北大学川内北キャンパス，2023/3/19(招待講演・主)　秋山
北陸応用数理研究会2022，石川県政記念しいのき迎賓館，2022　秋山
Methods and Applications in Mathematical Life Sciences(３領域合同研究集会)，京都大学吉田キャンパス，2022　秋山
非細胞素材の加工による「からだ」の形づくりの数理，日本数理生物学会年会，宮崎大学木花キャンパス，オンライン，2021　秋山

公募研究 #

＜発表論文18件＞ #

*Bekki N, Sato K, Ishiwata S. Emergence of Chaotic Oscillation in a Mathematical Model for Contractile System of Muscle. Journal of the Physical Society of Japan, 94(5), 054801 (2025)
Sato Y, Fosseprez C, Nishigami Y, Sato K, Orihara H, *Nakagaki T. Measurement of protoplasmic streaming over the entire body of Physarum plasmodium and estimation of the transport and mixing of protoplasma through the intricate vein network. Biophysics and Physicobiology, 22(1), e220002 (2025)
Itoh T, Kondo Y, Aoki Y, *Saito N. Revisiting the evolution of bow-tie architecture in signaling networks. npj Systems Biology and Applications, 10(1), 70 (2024)
*Saito N, Ishihara S. Cell deformability drives fluid-to-fluid phase transition in active cell monolayers. Science Advances, 10(19), eadi8433 (2024)
*Koike S, Tachikawa M, Tsutsumi M, Okada T, Nemoto T, Keino-Masu K, *Masu M. Actin dynamics switches two distinct modes of endosomal fusion in yolk sac visceral endoderm cells. eLife, 13, 95999.1 (2024)
*Yokota H, Tachikawa M. Simulation study on “ torsion ” and local structure of chromosome: Loop structure via torsion-adding loop extrusion. Journal of Advanced Simulation in Science and Engineering, 11(1), 54-72 (2024)
Nakamura YT, Himeoka Y, Saito N, *Furusawa C. Evolution of hierarchy and irreversibility in theoretical cell differentiation model. PNAS nexus, 3(1), pgad454 (2023)
Tsutsumi M, *Saito N, Koyabu D, *Furusawa C. A deep learning approach for morphological feature extraction based on variational auto-encoder: an application to mandible shape. npj Systems Biology and Applications, 9(1), 30 (2023)
Omachi Y, *Saito N, *Furusawa C, Rare-event sampling analysis uncovers the fitness landscape of the genetic code, PLOS Computational Biology, 19(4), e1011034 (2023)
Hatakeyama Y, *Saito N, Mii Y, Takada R, Shinozuka T, Takemoto T, Naoki H, *Takada S. Intercellular exchange of Wnt ligands reduces cell population heterogeneity during embryogenesis., Nature Communications, 14(1), 1924 (2023)
*Tachikawa M. Theoretical approaches for understanding the self-organized formation of the Golgi apparatus. Development, Growth & Differentiation, 65(3), 161-166 (2023)
Chiba T, Okumura E, Nishigami Y, Nakagaki T, *Sugi T, *Sato K. Caenorhabditis elegans transfers across a gap under an electric field as dispersal behavior. Current Biology, 33(13), 2668-2677.e3 (2023)
*Sato K. A cell membrane model that reproduces cortical flow-driven cell migration and collective movement. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 11, 1126819 (2023)
*Yokota H, Tachikawa M, Evaluation of loop formation dynamics in a chromatin fiber during chromosome condensation. Progress of Theoretical and Experimental Physics, 2022(5), 053J01 (2022)
Honda G, Saito N, Fujimori T, Hashimura H, Nakamura MJ, Nakajima A, *Sawai S. Microtopographical guidance of macropinocytic signaling patches. Proceedings of the National Academy of Sciences, 118(50), e2110281118 (2021)
*Saito N, *Sawai S. Three-dimensional morphodynamic simulations of macropinocytic cups. iScience, 24(10), 103087 (2021)
Imoto D, Saito N, Nakajima A, Honda G, Ishida M, Sugita T, Ishihara S, Katagiri K, Okimura C, Iwadate Y, *Sawai S. Comparative mapping of crawling-cell morphodynamics in deep learning-based feature space. PLOS Computational Biology, 17(8), e1009237 (2021)
Yamagishi JF, *Saito N, *Kaneko K. Adaptation of metabolite leakiness leads to symbiotic chemical exchange and to a resilient microbial ecosystem. PLOS Computational Biology, 17(6), e1009143 (2021)

＜学会発表14件＞ #

斉藤稔「数理モデルで読み解く細胞変形と多細胞動態」（定量生物学の会九州大学キャラバン招待講演）、2025年1月、九州大学
斉藤稔「変形可能細胞の数理モデルから迫る、⾼密度細胞集団の相転移」（第12回ソフトマター研究会）、2024年12月、大阪大学
斉藤稔「マルチカノニカルMCMCによるレアイベントサンプリングと進化モデル解析への展開」（トヨタコンポン研W S: 未踏探索の数理情報技術）、2024年11月、東京中野セントラルパークカンファレンス
斉藤稔「変形する細胞集団が示す相転移現象」（2024年度日本数理生物学会年会、シンポジウム招待講演）、2024年10月、北海道大学
佐藤勝彦、細胞運動を記述する膜モデル、北陸応用数理研究会2024、石川県政しいのき迎賓館、2024年3月
佐藤勝彦、細胞のクラスター移動の仕組みを解き明かす膜モデル、生体運動研究合同班会議2024、理化学研究所神戸キャンパス、2024 年 1 月
Nen Saito: “Cell Deformability Drives Fluid-to-Fluid Phase Transitions in Active Cell Monolayers” The 9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems (9 IDMRCS), Makuhari messe, 2023年8月
Nen Saito: “Mathematical modeling of cell morphology dynamics: from single-cell to multicellular systems” RIMS conference: Multidisciplinary Research on Nonlinear Phenomena: Modeling, Analysis and Applications, Kyoto University, 2023年11月
斉藤稔「細胞変形動態の数理モデリングおよび機械学習的アプローチ」（第96回日本生化学会大会、シンポジウム招待講演）、2023年11月、福岡国際会議場
佐藤勝彦、細胞がクラスターとなって移動する仕組みを解き明かす膜モデル、第61回日本生物物理学会、名古屋国際会議場、2023年11月
佐藤勝彦、細胞運動の力学的機構、日本数理生物学会、奈良女子大、2023/09
佐藤勝彦、細胞運動を表す膜モデル、日本物理学会第78回年次会、東北大学、2023/09
斉藤稔「マクロピノサイトーシス動態の 3D 数理モデリング」（2022年度日本数理生物学会年会、シンポジウム招待講演）、2022年9月、オンライン
斉藤稔「細胞変形動態の数理モデリング」，日本数理生物学会年会・企画シンポジウム「形から紐解く生命科学のデータと数理」，2021年9月、オンライン

＜主催シンポジウム5 件＞ #

学際領域の開拓と探求~ 統計物理・データ科学・MCMC ~（オンライン会議）, 2025年1月, オーガナイザー：斉藤稔（広島大学）・坂田綾香（統計数理研究所）・福島孝治（東京大学） HP: https://sites.google.com/view/gakusai-2025/
SSTB2025 -Spring School for Theoretical Biology 2025-, 広島大学ミライクリエ, 2025年2月, オーガナイザー：本田直樹, 藤本仰一, 粟津暁紀, 斉藤稔, 藤井雅史 HP: https://sites.google.com/view/sstb2025
SSTB2024 -Spring School for Theoretical Biology 2024-, 広島大学学士会館, 2024年2 月, オーガナイザー：本田直樹, 藤本仰一, 斉藤稔, 藤井雅史 HP: https://sites.google.com/view/sstb2024/
Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems（国際会議）August 3-5, 2023, 東京大学（駒場キャンパス）: organizers: Nen Saito (Hiroshima U.) Chikara Furusawa (U. of Tokyo/RIKEN), Shuji Ishihara (U. of Tokyo), Ayaka Sakata (Inst. Stat. Math.), Yusuke Himeoka (U. of Tokyo), Satoshi Sawai (U. of Tokyo), Yusuke Maeda (Kyushu U.) HP: https://webpark1926.sakura.ne.jp/biophys/
SSTB2023 -Spring School for Theoretical Biology 2023-, 広島大学ミライクリエ, 2023年3月, オーガナイザー：本田直樹, 斉藤稔 HP: https://sites.google.com/view/sstb2023/

研究項目B01（本研究項目は公募研究のみに設定） #

公募研究 #

＜発表論文23件＞ #

Inagaki T, *Kim J, Maeda E, Matsumoto T. Macroscopic creep behavior of spheroids derived from mesenchymal stem cells under compression. Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials, 161, 106816 (2025)
*Kim J, Niioka K, Maeda E, Matsumoto T. Application of hydrostatic pressure up-regulates Sost gene expression in osteocytic spheroids. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 89(2), 263-267 (2025)
Tomida K, *Kim J, Maeda E, Adachi T, Matsumoto T. Spatiotemporal analysis of multi-scale cell structure for hypertrophic chondrocyte differentiation in spheroid culture. Cell and Tissue Research, 397(3), 263–274 (2024)
Hayashi T, *Takeda H, Ishida S, *Imai Y. Folding of a hyperelastic sheet growing in a viscous fluid. Physics of Fluids, 36(5), 053315 (2024)
Asai Y, Ishida S, Takeda H, Nakaie G, Terahara T, Taniguchi Y, Takizawa K, *Imai Y. A computational model of red blood cells using an isogeometric formulation with T-splines and a lattice Boltzmann method. Journal of Fluids and Structures, 125, 104081 (2024)
*Takeda H, Asai Y, Ishida S, Taniguchi Y, Terahara T, Takizawa K, *Imai Y. Isogeometric boundary element analysis of creasing of capsule in simple shear flow, Journal of Fluids and Structures, 124, 104022 (2024)
Ito K, *Tsumori F. Magnetic-Pneumatic Hybrid Soft Actuator, Journal of Photopolymer Science and Technology, 36(3), 167-172 (2023)
Nishira Y, Ito K, *Tsumori F, Soft Motion of Dielectric Driven Balloon Actuator, Journal of Photopolymer Science and Technology, 36(3), 191-195 (2023)
Wang JF, Maeda E, Tsujimura Y, Abe T, Kiyonari H, Kitaguchi T, Yokota H, *Matsumoto T. In situ FRET measurement of cellular tension using conventional confocal laser microscopy in newly established reporter mice expressing actinin tension sensor. Scientific Reports, 13, 22729 (2023)
*Tamura A, Saiki M, Hongu J, Matsumoto T. Stiffness estimation of transversely anisotropic materials using a novel indentation tester with a rectangular hole. Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 26(8), 893-904 (2023)
Inagaki T, *Kim J, Tomida K, Maeda E, Matsumoto T. 3D quantitative assessment for nuclear morphology in osteocytic spheroid with optical clearing technique. Integrative Biology, 15, 1-6 (2023)
Ebara R, Ishida S, Miyagawa T, *Imai Y. Effects of peristaltic amplitude and frequency on gastric emptying and mixing: a simulation study. Journal of the Royal Society Interface, 20(198), 20220780 (2023)
Chattrairat K, *Yasui T, Suzuki S, Natsume A, Nagashima K, Iida M, Zhang M, Shimada T, Kato A, Aoki K, Ohka F, Yamazaki S, Yanagida T, *Baba Y. All-in-one nanowire assay system for capture and analysis of extracellular vesicles from an ex vivo brain tumor model. ACS Nano, 17(3), 2235-2244 (2023)
*Takahashi H, *Yasui T, Hirano M, Shinjo K, Miyazaki Y, Shinoda W, Hasegawa T, Natsume A, Kitano Y, Ida M, Zhang M, Shimada T, Paisrisarn P, Zhu Z, Ohka F, Aoki K, Rahong S, Nagashima K, Yanagida T, *Baba Y. Mutation detection of urinary cell-free DNA via catch-and-release isolation on nanowires for liquid biopsy. Biosensors and Bioelectronics, 234, 115318 (2023).
Nattasit P, *Niibe K, Yamada M, Ohori-Morita Y, Limraksasin P, Tiskratok W, Yamamoto M, *Egusa H. Stiffness-Tunable Hydrogel-Sandwich Culture Modulates the YAP-Mediated Mechanoresponse in Induced-Pluripotent Stem Cell Embryoid Bodies and Augments Cardiomyocyte Differentiation. Macromoleular Bioscience, 23(7), e2300021 (2023).
Maeda E, Ando Y, Takeshita K, *Matsumoto T. Through the cleared aorta: three-dimensional characterization of mechanical behaviors of rat thoracic aorta under intraluminal pressurization using optical clearing method. Scientific Reports, 12, 8632 (2022)
Takahashi K, Chida S, Suwatthanarak T, Iida M, Zhang M, Fukuyama M, Maeki M, Ishida A, Tani H, Yasui T, Baba Y, Hibara A, Okochi M, *Tokeshi M. Non-competitive fluorescence polarization immunosensing for CD9 detection using a peptide as a tracer. Lab on a Chip, 22(16), 2971-2977 (2022)
Fan Y, Wang JF, Kim J, Maeda E, *Matsumoto T. Dependency of deformation of cell nucleus on stretch direction of tissue: Relation to anisotropic response of aortic media to hypertension. Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials, 133, 105326 (2022)
Maeyama K, Ishida S, *Imai Y. Peristaltic transport of a power-law fluid induced by a single wave: a numerical analysis using the cumulant lattice Boltzmann method. Physics of Fluids, 34(11), 111911 (2022)
Jirayupat C, *Nagashima K, Hosomi T, Takahashi T, Samransuksamer B, Hanai Y, Nakao A, Nakatani M, J. Y. Liu, G. Z. Zhang, Tanaka W, Kanai M, Yasui T, Baba Y, *Yanagida T. Breath odor-based individual authentication by an artificial olfactory sensor system and machine learning. Chemical Communications, 58(44), 6377-6380 (2022)
Liu J, *Nagashima K, Hosomi T, Lei W, Zhang G, Takahashi T, Zhao X, Hanai Y, Nakao A, NakataniM, Tanaka W, Saito H, Kanai M, Shimada T, Yasui T, Baba Y, *Yanagida T. Water-Selective Nanostructured Dehumidifiers for Molecular Sensing Spaces. ACS Sensors, 7(2), 534-544 (2022)
Paisrisarn P, *Yasui T, Zhu Z, Klamchuen A, Kasamechonchung P, Wutikhun T, Yordsri V, Baba Y. Tailoring ZnO nanowire crystallinity and morphology for label-free capturing of extracellular vesicles. Nanoscale, 14(12), 4484-4494 (2022) Selected as an Outside back cover
Yasui T, Paisrisarn P, Yanagida T, Konakade Y, Nakamura Y, Nagashima K, Musa M, Thiodorus IA, Takahashi H, Naganawa T, Shimada T, Kaji N, Ochiya T, Kawai T and Baba Y. Molecular profiling of extracellular vesicles via charge-based capture using oxide nanowire microfluidics. Biosensors and Bioelectronics, 194, 113589 (2021)

＜学会発表25件＞ #

Matsumoto T, Wang JF, Maeda E, Kim J, Furunishi Y, Suzuki R, Hou Y: Visualization of Cellular Tension Change in Tissues with Transgenic Mice Expressing FRET-based Tension Sensor, APPW2025合同大会（130回日本解剖学会総会・全国学術集会／第102回日本生理学会大会／第98回日本薬理学会年会） (2025/3/17-19, 幕張メッセ)【シンポジウム依頼講演】
Yuta Nomura, Kazuya Saito, Fujio Tsumori, Development of beetle-hindwing-inspired deployable origami structure, International Symposium on Aero Aqua Bio-Mechanisms (2024)
Akito Nagaoka and Fujio Tsumori, Replication of Biotic Deployment Structures with Swellable Gels, International Symposium on Morphogenesis by Non-Cellular Materials (2024)
津守不二夫，ゲル材料による変形・成長する生体模倣構造，機械学会バイオエンジニアリング講演会（2024）招待講演
Fujio TSUMORI, Hydrogels for Soft Robotics: High-Resolution Magnetic Patterning and Highly Anisotropic Swelling, IUTAM Symposium on the Mechanics of Soft Materials and Soft Robots (2024) Invited.
永岡朗人，津守不二夫，異方性膨潤ゲルによる展開手法と航空宇宙工学分野への応用，日本航空宇宙学会西部支部講演会(2024)
野村優太，津守不二夫，甲虫後翅を模倣した折線配置の最適化および高効率展開構造の開発，日本航空宇宙学会西部支部講演会（2024）
Ryoma Shiraishi and Fujio Tsumori, Patterning on Tough Gels Using Laser Microprocesses and Nanotechnology Conf. (2024)
Kosei Ito and Fujio Tsumori, Magnetically Driven Soft Tentacles Utilizing Pneumatic Pressure-Induced Buckling, Microprocesses and Nanotechnology Conf. (2024)
野田聖，王軍鋒，キム・ジョンヒョン，前田英次郎，松本健郎：珪藻Aulacoseiraの被殻の形態形成に磁場が与える影響の解析，日本機械学会第35回バイオフロンティア講演会, 2D13 (2024/12/14-15, 横浜国大，横浜)
Ryoma Shiraishi, Fujio Tsumori, Micropatterning of Magnetic Properties on Gel Sheet for Soft Robotics, MRM2023 (2023)
Akifumi Kuba, Fujio Tsumori, Gel Actuator Dispersed with Bubbles Utilizing Gas-Liquid Phase Change, MRM2023 (2023)
野村優太，津守不二夫，甲虫の後翅を模倣した折り畳み・展開構造の開発　日本航空宇宙学会西部支部講演会（2023）
Yoshinobu Nishira, Fujio Tsumori, Soft Motion of Dielectric Balloon Actuator, The 40th International Conference of Photopolymer Science and Technology (2023)
Kosei Ito, Fujio Tsumori, Magnetic-Pneumatic Hybrid Soft Actuator, The 40th International Conference of Photopolymer Science and Technology (2023)
Matsumoto T, Wang JF, Maeda E, Tsujimura Y, Yokota H, Kitaguchi T: Generation and Evaluation of Transgenic Mice Expressing FRET-based Tension Sensor, 6th Japan-Switzerland Workshop on Biomechanics (2023/8/29-9/1, Otaru, Japan) 【Invited lecture】
ナノデバイスによる細胞外⼩胞研究のフロンティア開拓; 安井隆雄, RC-52 第70 回バイオ・マイクロ・ナノテク研究会, オンライン, 2023/3/15. 安井隆雄
Nanowire devices for extracellular vesicle analysis; T. Yasui, 公益社団法人化学工学会第88年会国際シンポジウム, Biomedical Engineering Challenges toward Intractable Diseases, Tokyo, 2023/3/16. 安井隆雄
ナノワイヤによる細胞外小胞解析とリキッドバイオプシーへの展開; 安井隆雄, 化学とマイクロ・ナノシステム学会第47回研究会, 仙台, 2023/5/14. 安井隆雄
ナノ材料による細胞外小胞の捕捉とリキッドバイオプシーへの展開; 安井隆雄, R025 先進薄膜界面機能創成委員会　第16回委員会・第15回研究会「医療と薄膜・界面」, 東京工業大学大岡山キャンパス西9号館ディジタル多目的ホール, 2023/8/8. 安井隆雄
Matsumoto T: Microscopic Estimation of Mechanical Environment in Soft Biological Tissues to Elucidate Biological Response Driven by Force and Deformation, The 9th World Congress of Biomechanics (2022/7/10-14, Taipei, Taiwan) 【Plenary Lecture】
西脇正就, キム・ジョンヒョン, 前田英次郎, 松本健郎: ３点曲げ試験による珪藻Aulacoseiraの被殻の力学特性の測定 (Evaluation of mechanical properties of frustule of a diatom Aulacoseira with 3-point bending test), 日本機械学会第34回バイオエンジニアリング講演会(2022/6/25-26, 福岡)
松本健郎，範勇，王軍鋒，キム・ジョンヒョン，前田英次郎：再生医療におけるメカノバイオロジーの役割: 荷重支持組織の力学応答とその異方性，第21回日本再生医療学会総会 (2022/3/18)【シンポジウム依頼講演】
ナノデバイスによる細胞外小胞の包括的解析; 安井隆雄, 第9回⽇本細胞外⼩胞学会, 東京,2022/10/25
T. Yasui Liquid biopsy using oxide nanowire microfluidics to address previously-unattainable analytical methods for biomolecules;, ICPAC KK 2022, Kota Kinabalu, 2022/11/27.

＜書籍3件＞ #

Oxide Nanowire-Based Devices for Biomolecule Analysis Towards Cancer Diagnosis, Z. Zhu and *T. Yasui, in Applications of Microfluidic Systems in Biology and Medicine, ed. M. Tokeshi, Springer Nature Singapore, Singapore, pp. 521 (2024).
安井隆雄, in 疾患バイオマーカーとしてのマイクロRNAと診断応用, eds. 落谷孝広 and 松﨑潤太郎, シーエムシー出版, 2022, pp. 246-254.
キム・ジョンヒョン，前田英次郎，松本健郎：第５章　力で組織・細胞を制御する，最先端ナノライフシステム研究（最先端ナノライフシステム研究編集委員会編）, 丸善プラネット, 30-35 (2022/3/29), 全221ページ

＜産業財産権4件＞ #

脂質ナノ粒子を融合する方法; 安井隆雄, 馬場嘉信; 特願2022-168904; 令和4年10月21日
微小液滴を形成する方法; 安井隆雄, 馬場嘉信; 特願2022-151862; 令和4年9月22日
対象液体に含まれる対象物質を分離する方法; 安井隆雄, 横井暁; 特願2022-078243; 令和4年5月11日
細胞の機能を変化させる方法; 安井隆雄, 馬場嘉信, 夏目敦至, 特願2020-36925, 令和2年3月4日

＜主催シンポジウム等3件＞ #

後藤寛貴「ピン止めと退縮による鋭い構造 -カブトムシの角とクワガタ虫の大顎を例に-」第28回いきものサロン，主催・モデレータ：津守不二夫 (2024年9月)
小沼健「３分で家が完成？！ -オタマボヤのハウス建築-」第26回いきものサロン主催・モデレータ：津守不二夫 (2023年12月)
IWACOM-IV, Imai Y,Kameo Y, Takeda H., OW1:Computational morphogenesis: understanding shapes emerging from mechanical interactions with environments, co-hosted by MEXT Grants-in-Aid for Transformative Research Area (A) “Material properties determine body shapes and their constructions Architect Bio)”

研究項目A01 #

計画研究 #

発表論文 ＜47件＞ #

＜学会発表100 件＞ #

＜書籍3件＞ #

＜主催シンポジウム14件＞ #

公募研究 #

＜発表論文83件＞ #

＜学会発表139件＞ #

＜書籍7件＞ #

＜主催シンポジウム10件＞ #

研究項目A02 #

計画研究 #

＜発表論文14 件＞ #

＜学会発表72件＞ #

＜主催シンポジウム等8件＞ #

公募研究 #

＜発表論文18件＞ #

＜学会発表14件＞ #

＜主催シンポジウム5 件＞ #

研究項目B01（本研究項目は公募研究のみに設定） #

公募研究 #

＜発表論文23件＞ #

＜学会発表25件＞ #

＜書籍3件＞ #

＜産業財産権4件＞ #

＜主催シンポジウム等3件＞ #

発表論文＜47件＞ #